梅毒的診斷應十分認真仔細，因為它和許多其它疾病的表現有相似之處，表現多樣，複雜且病程很長。有很長的時間處于潛伏狀态，診斷時必須結合病史，體格檢查及化驗結果，進行綜合分析判斷，必要時還需進行追蹤随訪、家庭調查和試驗治療等輔助方法。
一、病史：
1、不潔性交史：應盡量詢問患者的嫖娼史或其他不潔性交史以确定傳染源。如肛門有硬下疳，應詢問是否有肛交史。問清楚不潔性交的時間，對于确定梅毒的潛伏期是十分必要的。
2、現病史：有無陰部潰爛、皮膚紅斑、丘疹、濕疣史，有否發生過硬下疳、二、三期梅毒史。
3、婚姻史：有無涉外婚姻，結婚次數，配偶有無性病或可疑性病的臨床表現等。
4、分娩史：有無先兆流産、早産、流産和死産的病史，過去有無分娩胎傳梅毒兒史。
5、如有可疑先天性梅毒，應詢問父母是否患過梅毒，及兄弟姐妹受染情況及本人有無早期和晚期梅毒的症狀和體征。
6、如懷疑潛伏梅毒，詢問傳染史以及有無存在緻使血清試驗生物學假陽性的疾病。
7、治療史：是否做過驅梅治療，用藥劑量及療程，是否正規，有無藥物過敏史等。
二、體格檢查
1、一般檢查：生長發育狀況是否良好，精神狀态情況。
2、皮膚粘膜：根據早期和晚期梅毒的皮膚損害特點仔細檢查全身皮膚、粘膜、淋巴結、毛發、生殖器官、肛門、口腔等。
3、特殊檢查：眼、骨骼系統、心髒及神經系統的深入檢查或進行專科檢查。
三、實驗室檢查：
1、早期梅毒應做梅毒螺旋體暗視野顯微鏡檢查。
2、梅毒血清反應素試驗（如VDRL、USR或RPR試驗），有必要時再做螺旋體抗原試驗（如FTA-ABS或TPHA試驗）。
3、腦脊液檢查，以除外神經梅毒，尤其無症狀神經梅毒，早期梅毒即可有神經損害，二期梅毒有35%的病人腦脊液異常，因此要檢查腦脊液。
4、基因診斷檢測。
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