任何原因的阻塞都是尿路感染發展的主要危險因素，泌尿道，導管插入術和泌尿外科手術也是如此 ，前列腺炎，附睾炎，睾丸炎，腎盂腎炎，膀胱炎和尿道炎等炎症也可能成為男性尿路感染的細菌病因。
一、附睾炎
附睾炎是由附睾感染或炎症引起的臨床綜合征。這種情況是成年男性人群中急性陰囊最常見的原因。長期并發症包括膿腫，梗塞，複發，慢性疼痛和不孕症
附睾炎的病理生理學分為兩組，沙眼衣原體和淋病奈瑟氏球菌是35歲以下患者中最常見的病原體，而腸杆菌科和革蘭氏陽性球菌是老年患者的常見病原體。在任何一種情況下，感染都是由感染的尿液從前列腺尿道逆行上升到輸精管，最後進入附睾。
二、睾丸炎
睾丸炎是由病毒病原體引起的為數不多的泌尿生殖系統感染之一。由于腮腺炎疫苗的廣泛使用，睾丸炎不再是常見的感染。其他可引起疾病的病毒包括單核細胞增多症和水痘。與大多數泌尿生殖系感染不同，病毒顆粒通過血源途徑擴散到睾丸。肉芽腫性睾丸炎是罕見的，并且由結核，真菌和放線菌病的血源性傳播引起。
三、腎盂腎炎
腎盂腎炎是腎實質的感染。感染通常以膀胱逆行，上行的方式發生，但可能是血源性的。輸尿管口變得水腫并且在感染期間失去其單向瓣膜功能。細菌逆行進入上尿道并進入腎實質導緻臨床症狀。菌血症，特别是對于諸如金黃色葡萄球菌的有毒生物，可導緻腎盂腎炎伴局竈性腎膿腫。細菌粘附允許粘膜定植并随後通過上行途徑感染，在大多數菌株中發現大腸杆菌引起腎盂腎炎。基因型因素可能影響對這些粘附分子的尿路上皮易感性。來自革蘭氏陰性生物的内毒素可以延緩輸尿管蠕動。
四、細菌性膀胱炎
在泌尿生殖道的其他部分沒有伴随感染的細菌性膀胱炎在男性中很少發生，刺激性排尿症狀，例如尿頻尿急，夜尿，排尿困難和恥骨上疼痛的突然發作是臨床診斷。男性的細菌性膀胱炎并不常見，升高的殘留後殘留物使細菌繁殖至臨界水平。高排尿壓力和不良的膀胱順應性降低了對感染的自然尿路上皮抗性。
五、尿道炎
淋球菌性尿道炎是最常見的傳染性細菌性疾病。尿道非鱗狀上皮可以被淋病奈瑟氏球菌穿透，導緻尿道周圍微小的過度。壞死的碎片脫落到尿道腔内，産生乳狀陰莖分泌物，導緻男性尿路感染。
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