公元1865年，歐洲蔓延着一種可怕的蠶病，蠶大批大批地死掉，許多以養蠶為生的農民紛紛破産。
路易斯·巴斯德當時是巴黎高等師範大學的生物學教授，通過顯微鏡他發現蠶和桑葉上都有一種橢圓形的微粒，而且這些微粒還能遊動，能迅速繁殖後代。再看看沒染病的蠶和桑葉，并沒有這種微粒。巴斯德斷定，這種微粒就是緻病的罪魁禍首，并給它取了個名字“病菌”。
蠶農按照巴斯德的辦法，将染病的蠶全部燒死，阻止了蠶病的蔓延。可怎樣防止蠶病傳染呢？巴斯德帶了病蠶回實驗室進行研究。2年後，他成功了，方法也很簡單：把産完卵的雌蝦釘死，加水把它磨成漿糊，放在顯微鏡下觀察，蠶有病菌，就把它産的卵燒掉，蠶沒病菌，就把它産的卵留下，用沒有病菌的蠶卵殖，蠶病就不會傳染了。
從這以後，巴斯德開始研究人類緻病的原因，結果發現了多種病菌。他發現在高溫下，病菌很快就會失去生命力，于是向醫生宣傳高溫殺菌法。現在醫院裡使用的醫療器械，都要用高溫水蒸汽蒸煮，就是采用的巴斯德發明的消毒方法，後人稱為“巴氏消毒法”。
公元1880年，法國雞霍亂流行，巴斯德把導緻雞亂流行的病菌濃縮液注射到雞身上，當天雞就死了。病菌濃縮液放了幾個星期之後，巴斯德又給雞注射，雞卻沒有死。經過多次實驗，巴斯德認識到，病菌放一段時間後，不僅毒性大為減少，還有了抗病的效力。這樣，他制成了雞霍亂疫苗，增強了雞的抵抗力。
掌握了制造疫苗的方法後，巴斯德同樣将它運用到了人的身上。他組織助手們進行了無數次實驗，制成了傷寒、霍亂、白喉、鼠疫等多種疫苗現在打防疫針的免疫方法，就是巴斯德發明的。
除了細菌，巴斯德還發現了病毒。當時的歐洲，很多人在被瘋狗咬後會得“狂犬病”，先是恐水，然後全身抽而死，非常痛苦。巴斯德在顯微鏡下觀察狂犬的腦液髓液，并沒發現病菌。可是當他把狂犬髓液注射進正常犬的體内後，正常犬馬上就得病死了。“這是一種比細菌還要小的病源！巴斯德宣布，“叫做病毒”。
找到了根源，巴斯德開始着手治狂犬病。他把剛死的狂犬腦髓取出，懸挂在一個幹淨瓶子裡晾幹，兩星期後，把它加水磨成漿糊，注射進正常犬的體中，結果沒有發病。又過了兩個星期，他再次向這隻犬體内注射進剛死的狂犬的腦髓液，結果這隻正常犬也沒有任何反應。就這樣，一種治療狂犬病的疫苗誕生了。巴斯德把這種狂犬疫苗用來給人治病，再一次取得了成功。
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