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什麼時候做基因測序

圖文 更新时间:2024-07-21 14:22:31

【中關村在線原創】2013年,著名影星安吉麗娜朱莉宣布切除乳腺,并感謝當時丈夫布拉德皮特的支持。她做出這個決定,是通過基因測序的方式發現自己BRCA1缺陷,屬于乳腺癌高危人群。基因缺陷與乳腺癌的高相關性這個發現在1990年曾經轟動了科學界。今天,我們用很便宜的價格就可以進行基因測序了,為什麼會這麼便宜?靠譜嗎?能有什麼有意思的結果嗎?筆者本人就玩了一次,您别說,還挺有意思的。

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沃森與克裡克,1953年剛發現DNA的雙螺旋機構

DNA到基因測序都是諾貝爾獎

發現DNA的雙螺旋結構的時間并不長。當時沃森和克裡克都在劍橋大學的卡文迪許實驗室進行研究。1952年的時候,查伽夫發現了DNA裡面A和T、G和C數量總是相等,這讓沃森和克裡克立刻想到它們應該是配對出現的。他們通過分析之前富蘭克林拍攝的X射線衍射圖像得到了DNA是雙螺旋結構的結論。憑借這一發現,沃森和克拉克獲得了1968年諾貝爾生理醫學獎。從某種意義上說,他們開啟了分子生物學,重要性不言而喻。

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查看測序底片的桑格教授(圖:MRC Laboratory of Molecular Biology)

發現了結構,也知道了ATGC四種基本的嘌呤、嘧啶構成,它們是怎麼個排列順序?這就牽扯到了測序。弗雷德裡克·桑格,他是第四位獲得兩次諾貝爾獎的人,唯一一位兩次獲得化學獎的人。他第一次獲得諾獎是揭示了蛋白質的結構,第二次則是發明了給DNA測序的辦法,這種辦法今天稱之為Sanger法,用他的姓氏命名,過程很複雜,用他的辦法,在1975年測定了Φ-X174噬菌體的基因組序列,開啟了基因測序的先河。

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幾百元就可以體驗的測序服務

沒有他們的研究,今天的我們去花幾百元玩測序就無從說起。

桑格測序法,這種辦法很慢,且一次能測量的也不多,費用上也非常昂貴。第二代技術是在第一代技術的基礎之上,實現了大規模、平行的測序。由于可以自動讀取,所以測序的速度提高了很多。但饒是如此,直到2000年的時候,科學界才第一次完成了人類全基因組的測序。

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測序技術的進展

今天的DNA測序已經是第三代技術了,通俗的方法說就是測序的速度更快了,并且成本進一步降低。今天測序的成本僅僅是當年的50000分之一!前面說的人類全基因組測序,當時花了30億美元,而現在,進行全基因組測序,則隻要1000美元乃至更低,這就是技術進步帶來效率、成本上的提升。

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從1億美元到1000美元,生物領域技術快過摩爾定律

2006年,畢業于耶魯大學的安妮·沃西基看到了低成本測序的機會,成立了23andme公司,一口唾液就可以同過提取口腔上壁脫落的細胞裡面的DNA實現測序,當時的費用大約和人民币1000元左右,筆者雖然看到了報道躍躍欲試,但在美國太折騰就放棄了,好在後來國内類似的企業也多了起來,價格也在逐步降低,我這次測序用的是WEGENE提供的服務,标準價格499元,筆者的測試價格是399元,不過這隻是基礎版,還有幾千元的全基因組測序服務,檢測的基因位點更多,要看您自己的需求了。

重要!這種測序服務不具備任何診斷上的意義!切記切記切記!如果檢測的結果發現自己有什麼遺傳性的某些病症的風險,還是去醫院咨詢專業的大夫,這個測序當成一個玩樂,得到一些有趣的結果,發現自己更多秘密就好了。

整個流程其實非常簡單。測序機構給你快遞一個小盒過來,要求你向試管裡吐一口唾液,然後加上穩定劑搖晃均勻。再把這個試管封号快遞回去即可,注意要關聯自己的賬号和測序套件的編碼,否則就無法匹配了。

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上方的透明盒子裡有試管和穩定液,要郵寄回去

然後就是等待,因為液體要陸運,從北京到深圳時間要好幾天。在公衆号裡面可以看到進度,DNA提取成功、上機測序、生成報告都要時間,筆者本人一共等了10多天,收到了線上的報告。

剩下的問題就是期待:我的祖源到底什麼樣?其它的特征靠譜嗎?

每個人都有屬于自己的典型特征。現在分子生物學除了能确認乳腺癌、卵巢癌的基因高度相關性,還歸納總結出來很多規律,比如什麼位點上的表達會帶來哪些特征。

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看來唱歌跑調這事情真的遺傳……

我先看的就是這些檢測結果,通過這些已知的特征可以大概其的了解這測試準确性如何。在檢測報告裡面,有遺傳特征的子項。筆者本人B型血、幹燥耳垢、喝酒不臉紅等已知的特征都完全吻合。比較可惜的是絕對音準能力不明顯,筆者唱歌跑調這件事情看來是遺傳的……

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運動基因還行!我找到了繼續鍛煉下去的動力

作為運動愛好者,之前看BBC的紀錄片,每個人做一樣的鍛煉,為什麼有的人就效果好、力氣大、跑得快?BBC的紀錄片裡顯示,主持人的基因檢測結果表明,他居然從鍛煉得不到什麼收益,筆者在檢測之前也有這種擔憂,否則幾萬塊的公路自行車豈不是白買了?還好基因測試的結果給我動力,比如我屬于耐力中等、力量較好,鍛煉效果也較好的人群,并且膝蓋前十字韌帶較強,其實這準不準已經不是那麼重要,核心變成了基因還行,這是鞭策我繼續保持運動的動力。

筆者家裡并非沒有族譜,根據父親和祖輩記憶,家裡來自河南開封,然後定居北京-沈陽-吉林,這個過程中,祖輩多有和北方少數民族通婚的曆史,因此我特别想知道自己的祖源到底什麼樣。

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筆者的祖源來自多個地方

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祖輩基本都已離世,說不清這18%的南方漢族是哪位祖先帶來的基因

我明确已知的是父親的外祖母是滿族鑲黃旗人,母親的外祖母是“少數民族”、“眼窩深”。檢查的結果很有意思,也很出乎意料,20%左右的北方少數民族都不稀奇,關鍵是筆者基因裡面南方漢族是哪裡來的?筆者問了父母,都說不清楚,母親前陣子折騰族譜我也出了一些力氣,可以溯源都是山東人,看來是祖輩或是曾祖輩遷居北方的南方人了。

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追溯祖源中引入少數民族基因的代數,可以追溯10代先祖

有人說基因相關性,就是21世紀算命,其實這麼說或許也有些道理。因為人的基因太多,但是能定位哪些基因有明确作用和相關性的其實不多,太多的秘密有待揭開,而且這種幾百元一次的檢測,測序的位點也并不多,隻是能告知比較有意思的一些相關性,真如前文所述,并不具備診斷上的意義,不過就筆者本人來說,得到積極的檢測結果,成為敦促自己不浪費基因,好好鍛煉健身的動力,這獲得的價值遠大于開銷的399元。

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這幾天購買499-100還送曲奇餅幹,我那時候不送

被種草了?你也想試試?下面這裡就是京東WEGENE的官方旗艦店鍊接,聲明一下,微基因與筆者及中關村在線并無利益往來,隻是筆者個人純粹的好奇心,嚴肅的醫學診斷,您還是要去醫院問大夫。

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