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研究計算機的科學家

健康更新时间:2024-05-01 12:04:17

研究計算機的科學家（上海科學家的計算機發現）1

病毒疫苗研究都在實驗室？答案是否定的。在生物信息學高速發展的今天，計算機也成為重要助力之一。

同濟大學31日傳出信息，該校曹志偉教授團隊與上海市公共衛生臨床中心合作，計算得出，新型冠狀病毒（2019-nCoV）與SARS存在交叉保護表位，這一發現有望推動中和阻斷抗體研發，加速疫苗研究。1月30日，相關論文在《遺傳學報》在線發表。

2019年12月以來，武漢新型冠狀病毒感染引起的肺炎傳播迅速，疫情緊急，研發中和保護性抗體迫在眉睫。然而抗體研發所需的關鍵信息-中和保護表位，尚未被揭示。

研究表明，S蛋白是冠狀病毒與宿主細胞表面ACE2受體結合、進而介導病毒入宿主細胞的關鍵表面蛋白，是疫苗抗體研發的重要靶點。基于具有自主知識産權的免疫原性計算工具CE-Blast，研究小組對所有冠狀病毒的S蛋白進行了系統性的結構模拟和免疫原性掃描，計算了新病毒與已知17種冠狀病毒亞型之間的免疫原性距離，發現新病毒S蛋白的免疫原性總體上與SARS更為接近。進一步計算揭示，2019武漢新冠狀病毒與SARS冠狀病毒的S抗原在受體接合區域（RBD）上存在潛在交叉反應表位。

研究計算機的科學家（上海科學家的計算機發現）2

新型冠狀病毒（2019-nCoV）與SARS存在交叉保護表位，這一發現有望推動中和阻斷抗體研發

同濟大學供圖

最為重要的是，其中一處與人ACE2受體結合位點緊密毗鄰。因此，針對該表位區域研發抗體，空間位阻效應可能阻斷病毒與ACE2受體的結合，有望起到病毒感染保護作用。同時，針對該表位區域的SARS抗體，可能對2019新病毒具有潛在臨床治療價值。

“我們在算法上有積累，這次做得非常快，很着急，”曹教授介紹，1月15日從網上下載了相關數據， 21号結果算出來了。據了解，此次采用專有免疫計算技術進行大規模掃描，可在突發/新發傳染病早期，為抗體疫苗研發提供理論提示與快速引導。

為加快新病毒抗體與疫苗研發，同濟大學曹志偉團隊向研發機構免費共享抗體研發相關的計算預測技術，方便各方研究團隊盡早掌握疫苗抗體研究關鍵信息。

欄目主編：徐瑞哲文字編輯：徐瑞哲圖片編輯：曹立媛

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