淋菌性結膜炎病原菌為淋球菌，又稱奈瑟淋球菌，是一種革蘭氏陰性雙球菌，呈卵圓形或腎形，成對排列，其接觸面平坦或稍凹，直徑約0。6～0。8um，常存在于多形核白細胞的胞漿内。
淋球菌離開人體後不易生長，對理化因子的抵抗力弱，攝氏42度存活15分鐘，50℃隻存活5分鐘；在完全幹燥的環境中1～2小時即死亡，但在不完全幹燥的環境和膿汁中則能保持傳染性10餘小時，甚至數天。對一般消毒劑亦很敏感，1：4000硝酸銀溶液7分鐘死亡，1%苯酚1～3分鐘死亡，0。1%升汞溶液可使其迅速死亡。
淋球菌為嚴格的人體寄生菌，常存在于急性尿道炎與陰道炎的膿性分泌物的白細胞中，形态染色類似于腦膜炎球菌。本菌培養要求高，一般不易培養，需在培養基中加入腹水或血液。抵抗力弱，不耐幹燥和寒冷，對一般消毒劑敏感，對磺胺、青黴素較敏感，但易産生耐藥性。
淋球病的緻病機理複雜，其毒力與菌毛、莢膜、脂多糖和外膜蛋白的某些成份有關。淋球菌産生的lga1蛋白酶能裂解人lga1，因此也是不可忽視的毒力因子。淋球菌lga1蛋白酶産生的抗體具有中和該酶的活性，并能中和腦膜炎雙球菌和部分流感杆菌lga1蛋白酶的活性。
人類是淋球菌唯一的自然宿主，淋病主要由性接觸而傳播。淋球菌侵入泌尿生殖系統繁殖，男性發生尿道炎，女性引起尿道炎和子宮頸炎。如治療不徹底，可擴散至生殖系統。胎兒可經産道感染造成新生兒淋病性急性結膜炎。人類對淋球菌無自然免疫力，均易感，病後免疫力不強，不能防止再感染。
微生物學檢查主要是采取尿道膿性分泌物塗片，革蘭氏染色鏡檢，如在中性粒細胞中發現革蘭氏陰性雙球菌時，就有診斷價值，必要時進行分離培養。對患者應早期用藥，徹底治療。
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