ChemDraw是一款專業的化學結構繪制工具,它是為輔助專業學科工作者及相關科技人員的交流活動和研究開發工作而設計的。它給出了直觀的圖形界面,開創了大量的變化功能,隻要稍加實踐,便會很容易地繪制出高質量的化學結構圖形。軟件使用範圍廣泛,可用于設計化學圖、分析化學實驗制作各種樣式的實驗分析圖、制作3D模型、管理實驗數據以及繪制化學結構、反應式以及生物通路圖等,為化學工程、分析化學、有機化學、材料科學、高分子材料以及生物醫藥等方面提供了完美的解決方案。
前面的推文中,我們為大家介紹了科研繪圖必備之ChemDraw:你可能忽略的基本技巧(一),本期内容小編繼續為大家介紹ChemDraw的使用技巧,希望能幫助大家更快的掌握ChemDraw這款軟件。
1标記同位素及電荷
化學元素中同位素的标記即在原子的左上角标記質量數。首先在要标記同位素的原子前輸入質量數,然後選擇輸入的質量數,單擊工具欄中的上标按鈕即可。
标記電荷與同位素标記類似,在原子标記的位置輸入相應的元素,然後輸入正電荷( )或負電荷(-),随後選中正或負電荷,然後單擊工具欄中的上标按鈕,即可完成電荷的标記。
2繪制箭頭、弧及其他圖形
在化學結構式和反應方程式的繪制中經常會用到箭頭,ChemDraw中有大量的箭頭工具可以使用,單擊圖形工具箱中的箭頭工具打開箭頭工具面闆,可根據需要進行選擇。按住Shift鍵并将光标指向箭頭頭部,同時按住鼠标左鍵拖動可進行箭頭的拉伸、縮短和轉向。
單擊圖形工具箱中的基元工具即可打開基元工具面闆,基元工具面闆中包含一些球形工具、線工具、方框工具和弧形工具。球形工具可用于繪制3D分子工具;線工具用于繪制直線、虛線以及波浪線等;方框工具可以把所繪結構放到方框中,更為正規;弧形工具可以繪制固定角度的弧,配合使用Shift鍵可以進行弧的旋轉和調整大小等操作。
繪制曲線可借助圖形工具箱中的鋼筆工具進行繪制,可通過控制曲線的弧度獲得各種各樣的曲線類型。
3繪制共轭苯環
繪制共轭苯環的方法非常簡單,隻需選擇圖形工具箱中的環己烷工具,然後按住Ctrl鍵,即可在繪圖區鼠标單擊繪制得到苯環的共轭式。
4繪制軌道及化學符号
軌道工具主要用于化學結構繪圖中的電子軌道繪制。在ChemDraw中可快速的繪制s-軌道、p-軌道、d-軌道等多種軌道。隻需在圖形工具箱中的軌道工具面闆選擇合适的軌道即可繪制。
5繪制反應設備
ChemDraw中提供了許多反應設備的模型,我們可以很方便地通過模闆工具中的“Clipware,part 1”和“Clipware,part 2”模闆工具來選擇不同的反應設備或實驗用品。通過選擇不同的裝置并進行合理的組合可以搭建出各種反應裝置。
6ChemDraw與Word及Chem3D關聯
①與Word關聯
我們可以直接在Word中編輯化學結構式,這樣如果化學結構式有錯誤時,可以很方便地進行修改。繪制好結構圖形時,通過Ctrl C複制圖形,在Word中直接Ctrl V粘貼即可,此時,化學結構式以“CS ChemDraw Drawing對象”的形式出現在Word中,選擇Word中化學結構式的圖形,右鍵選擇“CS ChemDraw Drawing對象”>Edit,即可在Word中直接彈出結構式的修改窗口。當然,也可雙擊該結構,直接跳轉至ChemDraw中進行修改,修改完成後,直接關掉ChemDraw窗口,返回到Word窗口,即可以看到化學結構式已同步修改。
②與Chem3D關聯
除了2D結構外,很多時候需要構建3D結構,這時就需要使用到Chem3D。選中結構後,在菜單欄點擊View>Show Chem3D HotLink Window即可顯示Chem3D預覽窗口,可以看到該結構的3D結構,在預覽窗口中可以進行一些基本操作,如:移動、選項、縮放、轉動、搖擺等。如果需要執行更多操作,可以點擊左下角的Launch Chem3D浮動按鈕,打開Chem3D軟件。
Chem3D中可以實現更多功能,有關Chem3D的使用方法,我們會在之後的推文中詳細說明。
7繪制薄層色譜
薄層色譜,或稱薄層層析(thin-layer chromatography),是分析化學中的常用分析工具。在ChemDraw中可以很方便地繪制薄層色譜。在繪圖工具中找到薄層色譜圖(TLC)即可繪制,在繪圖區單擊,在彈出的“Insert TLC Plate”對話框可輸入色譜标記點的數目,可得到TLC模闆;
右擊繪制的TLC模闆,在彈出的快捷菜單中選擇“Add Lane”來橫向加點,選擇“Add Spot”來縱向加點;通過這兩種方式可在色譜圖中添加點樣,所加的色譜點可以有多種形式,在繪圖區右擊,可以改變點的形狀、空心和實心;
通過按住Shift移動光标可改變點樣形狀,當然我們上期為大家介紹的按住Ctrl鍵并移動點,可以在同一垂直線上增加點;選擇TLC圖片,将光标移動至邊框上,可以調整TLC圖的長、寬;
選擇色譜點,右鍵在快捷菜單中選擇“Color”中的顔色可以任意設置點樣的顔色;
顯示Rf值,Rf值全稱是Retention Factor Value,又稱比移值,是紙上層析法估算平面色譜的專業術語。紙上層析法的原理是溶劑從原點滲透到距離a(一般在20-30厘米時測定)的時候,如果位于原點的物質從原點向前移動到b,那麼b/a的值(0.0-1.0)就是這種物質的Rf值。在繪制的薄層色譜圖中,選中色譜點,右鍵在快捷菜單欄中點擊“Show Rf”即可。
8化學式轉化為化學結構式
在ChemDraw中,可以直接由化學式轉換為化學結構式,選中化學式後,在菜單欄點擊Structure>Expand Label即可。
9增加化學結構的中心
繪制化學結構時,有時需要增加化學結構的中心,ChemDraw中可以自動添加化學結構的中心。選中環結構後,在菜單欄點擊Structure>Add Multi Center Attachment,結構中心即多出一個星号,為結構中心。
10建立自己的結構庫
對于經常需要繪制的結構來說,我們可以建立自己的結構庫,之後作圖時隻需調用結構庫中的模闆即可,能夠節省大量的時間。在圖形工具欄中找到模闆工具,鼠标左鍵按住後選擇New Templates,在新打開的窗口中繪制需要添加模闆的結構即可,畫好之後,關閉該窗口,提示是否保存,點擊OK保存即可,下次使用時即可從模闆工具中找到該結構。
以上就是為大家分享的ChemDraw使用的一些技巧,覺得有用的小夥伴可以收藏備用哦~
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