冷凍幹燥機的工作原理是将被幹燥的物品先凍結到三相點溫度以下，然後在真空條件下使物品中的固态水份（冰）直接升華成水蒸氣，從物品中排除，使物品幹燥。物料經前處理後，先進行速凍，再真空幹燥升華脫水，之後在後處理車間包裝。冷凍幹燥機真空系統為升華幹燥倉建立低氣壓條件，加熱系統向物料提供升華潛熱，制冷系統向捕水器和幹燥倉提供所需的冷量。冷凍幹燥機對凍幹制品的質量要求是：生物活性不變、外觀色澤均勻、形态飽滿、結構牢固、溶解速度快，殘餘水分低。要獲得高質量的制品，對冷凍幹燥機的理論和工藝應有一個比較全面的了解。凍幹工藝包括預凍、升華和再凍幹三個分階段。冷凍幹燥機合理而有效地縮短凍幹的周期在工業生産上具有明顯的經濟價值。 冷凍幹燥機關機操作： 1. 首先慢慢（一定要慢，否則真空泵裡的油會倒吸）打開“充氣閥”，同時按下“真空泵”電源開關鍵，使空氣緩慢進入冷阱。如需充入惰性氣體，則将惰性氣體的減壓導管連接“充氣口”，然後慢慢打開“充氣閥”，使惰性氣體緩慢進入冷阱。 2. 依次按下“真空表”，“制冷機”開關，關閉，此時指示燈滅，“總電源”開關鍵，冷凍幹燥機同開機時按下三秒無顯示後放開此鍵。 3. 提起有機玻璃罩，将物品取出，保存，冷凍幹燥機冷凍幹燥過程結束。 4. 冷阱中的冰化成水後，打開“放水閥”将水排出。 5. 清理冷阱内的水份和雜質，妥善保養冷凍幹燥機設備。 6. 真空泵不用時，應蓋上出水嘴，以防髒物進入冷凍幹燥機。 7. 多歧管型，應逐個關閉橡膠閥并取下凍幹瓶後再重複關機操作。
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