綠藻、褐藻、紅藻的區别主要是其色素不同。
綠藻約6700種。光合色素的比例與種子植物和其他高等植物相似。典型的綠藻細胞可活動或不能活動。具有一中央液泡,色素在質體中,質體形狀因種類而異。細胞壁由兩層纖維素和果膠質組成。食物以澱粉的形式儲存于質體内的蛋白核中。
褐藻一群較高級的藻類,約1500種,分布大陸沿岸的冷水水體,淡水中罕見。其顔色取決於褐色素與綠色素的比例,從暗褐到橄榄綠。充氣的氣囊使葉狀體的光合部分浮於或接近水表。
紅藻約3000種。紅藻,絕大多數為多細胞體、極少數為單細胞體的藻類。藻體紫紅、玫瑰紅、暗紅等色。紅藻絕大部分生長于海洋中,分布廣,種類多,據統計約有558屬、3740餘種,又分為兩個亞綱:紫菜亞綱和真紅藻亞綱。其中不少紅藻有重要經濟價值。除食用外,還是醫學、紡織、食品等工業的原料。
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