1、物理過濾:利用機械辦法将水中較大的顆粒隔出掉。如剩餘的飼料顆粒、死亡魚隻的屍骨、魚體的排洩物、分泌物、嘔吐物、體表粘液等,一般多使用海綿、噴膠棉、細網目的尼龍網、棕榈葉纖維等。通常是設置在過濾系統的初始端,便于清洗。
2、生物過濾: 培養有益菌菌,通過細菌分解有害元素,如:氨鹽、亞硝酸鹽、硝酸鹽酸鹽等等。常用的濾料有:生化球、陶瓷環、玻璃環、珊瑚砂等等(最主要的過濾方式,維持生态系統)。
3、化學過濾: 利用化學除去水的雜質的辦法,所使用的制劑有水質安定劑、絮凝劑、除藻劑、蛋白質分解劑、除臭劑等等。
4、吸附過濾:木材、煤炭、果殼、動物骨等含碳量極高的物質能吸附海水中的蛋白質、微量元素、脫色、除異味,連臭氧的分子也能被它吸收。魚兒的尿液,水中的微藻以及藥物也都能被它吸附掉。
5、光合細菌,水族箱中若光合細菌,它将那些有機質或硫化氫等物質加以吸收利用,而使耗氧的異營性微生物因缺乏營養而轉為弱勢,因而降低發生有毒分解産物的機會,同時,底質中的水質借以得到淨化,而促使養殖的水族生物的健康成長。
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