對于你的紅耳巴西龜來說，不管你想怎麼養，至少應該像搭建一個魚缸一樣去搭建一個龜缸。如果你曾經很認真的養過魚，你就會知道它們需要健康、平衡的水才能茁壯成長。巴西龜的耗水量不那麼大，但在這方面仍需要一些關注。例如，pH值對龜的影響不像對魚的影響那麼大，但你最好還是去寵物店買一套測量工具來測量一下。pH值為6-8的水對巴西龜比較好，如果需要的話，你可以購買寵物店的其他産品來調節pH值。
就像魚缸一樣，你需要将你龜缸裡的水循環起來。“循環”指的是健康的龜或魚體内的氮循環。氮循環是由有益的細菌完成的，它們将廢物，如亞硝酸鹽和氨，轉化為硝酸鹽，而硝酸鹽可以通過水的循環來控制。最理想的情況是，這些工作應該在你把巴西龜放入龜缸之前完成，但是如果時間緊急，你也可以在買龜之後完成這個工作。
飼養過程中你需要始終如一地檢查龜缸中水的氨、亞硝酸鹽和硝酸鹽。寵物店有專門測試這些的工具，可以告訴你什麼時候已經高到了有危險的程度。當然，與魚類相比，巴西龜可以承受更高強度的污染，但為了安全起見，不要讓它比試劑盒建議的高很多。如果你的廢棄物指标正在飙升，那就更頻繁地換水(如果有必要的話，每周換水3-4次)來控制它。
另一個問題是氯，氯是一種不會困擾大多數巴西龜的東西，但是如果你的自來水聞起來像漂白劑，你可能會遇到一些問題。過多的氯會引起巴西龜的眼部問題，所以為了安全起見，最好使用脫氯器——尤其是在換水的時候。
關于飼養紅耳巴西龜的水質，最重要的當然是你的過濾器。高質量的過濾不僅有助于保持一個健康的環境，它也能減低你清潔龜缸的頻率。過濾器可以過濾在龜缸内産生的廢物，幫助分解潛在的有害物質。過濾器的類型、強度、形狀、選項和價格各不相同。盡量使用大的過濾器。過濾桶加水泵是最好的選擇，可以為有益細菌的生長提供良好的基質。因為你的巴西龜大部分時間都呆在水裡，他們在水裡吃飯，睡覺，把廢物留在水裡，所以這些水必須經過過濾，應該集中精力保持最好的水環境。不潔淨的水是造成巴西龜的不适、生病和感染的主要原因。
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