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怎麼用r語言計算卡方檢驗

健康 更新时间:2024-11-29 13:35:10
用pwr包做功效分析

R語言中的pwr包可以實現很好的功效分析,包中包含了一系列非常重要的函數。對于每個函數,用戶可以設定四個量(樣本大小、顯著性水平、功效和效應值)中的三個量,第四個量将由軟件計算出來。

怎麼用r語言計算卡方檢驗(用R語言做數據分析)1

四個量中,效應值是最難規定的,計算效應值通常需要一些相關估計的經驗和對過去研究知識的理解。但是如果在一個特定的研究中,你對需要的效應值一無所知,又該怎麼辦呢?接下來将介紹pwr包在常見統計檢驗(t檢驗、方差分析、相關性、線性模型、比例檢驗、卡方檢驗)中的應用。在調用以上函數時,請确保已經安裝并載入pwr包。

t檢驗的功效分析

對于t檢驗,pwr.t.test()函數提供了許多有用的功效分析選項,格式為:

pwr.t.test(n=, d=, sig.level=, power=, alternative=)

其中,

1、n為樣本大小;

3、sig.level表示顯著性水平(默認為0.05);

4、power為功效水平;

5、type表示檢驗類型:雙樣本t檢驗(two.sample)、單樣本t檢驗(one.sample)或相依樣本t檢驗(paired)。默認為雙樣本t檢驗。

6、alternative表示統計檢驗時雙側檢驗(two.sided)還是單側檢驗(less或greater)。默認為雙側檢驗。

例子:我們想評價使用手機對駕駛員反應時間的影響,零為假設H0:u1-u2=0,u1是駕駛員使用手機時的反應時間均值,u2是駕駛員不使用手機時的反應時間均值。假設我們拒絕該零假設,備擇假設就是H1:u1-u2 != 0,即兩種條件下反應時間的均值不相等。現挑選一個由不同個體構成的樣本,将他們随機分配到任意一種情況下,參與者邊打手機,邊在一個模拟器中應對一系列駕駛挑戰;第二種情況,參與者在一個模拟器中完成一系列相同的駕駛挑戰,但不打手機。然後評估每個個體的總體反應時間。

假定将使用雙尾獨立樣本t檢驗來比較兩種情況下駕駛員的反應時間均值。如果根據過去的經驗知道反應時間有1.25s的标準偏差,并認定反應時間1s的差值是巨大的差異,那麼在這個研究中,可設定要檢測的效應值為d=1/1.25=0.8或者更大。另外,如果差異存在,我們希望有90%的把握檢測到它,由于随機變異性的存在,我們也希望有95%的把握不會誤報差異顯著。這時,對于該研究需要多少受試者呢?

> library(pwr)

> pwr.t.test(d=.8, sig.level = .05, power = .9, type = "two.sample", alternative = "two.side")

Two-sample t test power calculation

n = 33.82555

d = 0.8

sig.level = 0.05

power = 0.9

alternative = two.sided

NOTE: n is number in *each* group

結果表明,每組中需要34個受試者(總共68人),這樣才能保證有90%的把握檢測到0.8的效應值,并且最多5%的可能性會誤報差異存在。

現在變化一下問題。假定在比較這兩種情況時,我們想檢測到總體均值0.5個标準誤差的差異,并且将誤報差異的幾率限制在1%内。此外,受試者隻有40人,那麼在該研究中能檢測到這麼大總體均值差異的概率是多少呢?

假定每種情況下受試者數目相同,可以進行如下操作:

> pwr.t.test(n=20, d=.5, sig.level = .01, type = "two.sample", alternative = "two.side")

Two-sample t test power calculation

n = 20

d = 0.5

sig.level = 0.01

power = 0.1439551

alternative = two.sided

NOTE: n is number in *each* group

結果表明:在0.01的先驗顯著性水平下,每組20個受試者,因變量的标準差為1.25s,有低于14%的可能性斷言差值為0.625s或者不顯著(d=0.5=0.625/1.25)。換句話說,我們有86%的可能錯過我們要尋找的效應值。因此,可能需要慎重考慮要投入到該研究中的時間和經曆。

上面的例子都是假定兩組樣本大小相等,如果兩組中樣本大小不同,可用函數:

pwr.t2n.test(n1=, n2=, d=, sig.level=, power=, alternative=)

其中n1和n2是兩組樣本大小,其他參數含義與pwr.t.test()相同,可以嘗試改變pwr.t2n.test()函數的參數值,看看輸出的效應值如何變化。

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