佳木斯大學坐落于中國最早迎接太陽升起的地方黑龍江省佳木斯市。
學校始建于1947年；
1995年6月27日，經原國家教委批準，由佳木斯醫學院、佳木斯工學院、佳木斯師範專科學校和原佳木斯大學四所學校合并組成佳木斯大學。
1996年11月21日，佳木斯大學正式挂牌啟動；
2000年5月，佳木斯市糧食幹校并入；
2003年5月，富錦師範學校并入；
2003年12月，黑龍江省理工學校并入；
2018年2月，學校入選黑龍江省高水平大學和優勢特色學科建設高校及建設學科。
學校是黑龍江省重點建設的省屬高水平大學，是黑龍江省門類較全且含有醫學專業的綜合性大學，是“十三五”期間“國家百所中西部高校基礎能力建設工程（二期）支持高校”，是黑龍江省首批深化創新創業教育改革示範高校。
學校占地1965 畝（131萬平方米），建築面積57.6萬平方米，設有25個學院和4個研究院、1個研究基地，82個研究所（室）。學校學科專業設置涵蓋文學、理學、工學、醫學、經濟學、教育學、法學、曆史學、管理學、農學、藝術學等十一大學科門類，現有2個博士學位授權一級學科，14個碩士學位授權一級學科，1個碩士學位授權二級學科，9個碩士專業學位授權點、1個博士後科研流動站和3個博士後科研工作站，76個本科專業；國家級特色專業3個、省級重點專業11個、省級重點學科7個、省高校重點實驗室3個、省級實驗教學示範中心4個、原省級精品課程13門、省級精品視頻公開課程2門、省級“精品在線開放課程”5門、“東西部高校課程共享聯盟上線課程”5門；獲批國家級專業綜合改革試點項目1個，省級專業綜合改革試點項目4個；學校成為中國高等教育學會醫學教育專業委員會綜合性大學醫學教育研究學組組長單位，黑龍江省高校優質課程聯盟副理事長單位；加入中俄醫科大學聯盟、東西部課程聯盟、全國地方高校UOOC （ University Open Online Course）聯盟和中國醫學教育慕課聯盟。教育部金屬耐磨材料與表面技術工程研究中心、國家衛計委康複醫學人才培訓基地、教育部赴俄留學培訓基地、黑龍江省全科醫學培訓中心、黑龍江醫院住院醫師規範化培訓基地、黑龍江省佳木斯中俄科技合作中心、黑龍江省高校校企共建耐磨材料研發中心、黑龍江省三江區域文化研究學術交流基地設在我校；《佳木斯大學社會科學學報》、《佳木斯大學自然科學學報》、《黑龍江醫藥科學》三個學報在國内外公開發行。
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