本州島面積為227,414平方千米，海岸線長度為12,181千米。
北海道島的面積為78,073平方千米，海岸線長度為2760千米，這說明北海道的海岸線較為平直。
九州島面積為36,554平方千米，海岸線長度為8926千米，長度遠遠超過面積大自己一倍的北海道島，說明九州島的海岸線最為曲折。
四國島面積18，256平方千米、海岸線長度為29,46千米。
沖繩島1，220平方千米，海岸線長度為1642千米。
日本海岸線的總長度為28,455千米。
日本面積60平方千米以上的島嶼，自北而南如下：
北海道日本海一側有利尻(182.8)、禮文(81.7)兩島及西南的奧尻島(143.0)。
除本州島的佐渡島(856.6)和隐岐島的島後(242.8)、東京的大島(91.0)之外，淡路島(592.9)、小豆島（香川）(152.4)、，山口縣的屋代島（大島）(129.7)、愛媛縣的大三島(63.8)、廣島市對岸的江田島(91.0)等，都分布在濑戶内海。
其餘的島嶼都在九州地方，按所屬府、縣将其主要島嶼如下：
長崎縣有對馬下島(435)、對馬上島(247)、壹岐島(133.8)、五島列島的福江島(327)、五島列島的中通島(167.8)、平戶島(165.2)；
熊本縣有天草下島(571.2)、天草上島(224.5)；
鹿兒島縣有屋久島(502.6)、種子島(446.4)、長島(90.2)；
沖繩縣有宮古島(164)、石垣島(216)、西表島(287)。
這些半島、岬角和島嶼，使日本列島的地表平面形态發生了變化，成為冬季季風吹拂和夏季台風來襲時的屏障。在該處的背風面，往往發展為避風港和天然良港。
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