枝條菌種通常指的是用竹簽、木條等材料來制作的三級種，是平菇、木耳等常規食用菌常見的菌種。枝條菌種具有萌發快，接種方便、快捷的特點，整個接種過程不需要全開袋口，培養基暴露的時間短，這樣不僅提高了接種效率，還降低了污染率。同時接種後，枝條深入培養基内部，菌種從上、中、下多點萌發，菌絲從裡向外呈立體輻射狀蔓延，滿瓶、滿袋時間可提早5～7 d，提高了出菇同步性。

選擇邊材多、心材少、皮厚、營養豐富、韌皮部與木質部結合緊密的樹木，如栗樹、梧桐、楊樹等木材均是比較好的選擇。枝條長度由種木和栽培袋大小而定，長度一般 12～15 cm，寬 0.5～0.7 cm，厚 0.5～0.7 cm。也可采用一次性筷子，雪糕棍等材料生産枝條菌種。

準備好的枝條要先讓枝條吸足水分，具體可采用以下方法：

（1）浸泡法：将枝條整捆放入1%石灰水中浸泡，水淹沒枝條水面距枝條10 cm，然後上用重物壓住。一般連續浸泡24 h後檢查枝條是否泡透，方法是用錘子把浸泡後的枝條砸開，看有無白心，如有應繼續浸泡，如無說明已泡透。若是低溫季節，浸泡時間還需相應延長至36 h，使枝條含水量達到60%，達不到此要求的可煮枝條補水。枝條含水量達到标準後，撈出放入塑料筐瀝水後拌料裝袋。

（2）水煮法：先将量好的水倒入大鍋内，再将葡萄糖、磷酸二氫鉀、硫酸鎂（配方：100 kg水加葡萄糖1 kg，磷酸二氫鉀0.5 kg，硫酸鎂0.15 kg）溶解于水中，将枝條倒入鍋内，加熱煮沸30～40 min，随機從鍋内抽取數根枝條，用錘子砸開枝條觀察枝條吸收營養液的情況，煮沸到枝條無白心為止，再撈出瀝水。

輔料主要是填充在枝條間隙，以補充營養，利于菌絲定殖，添加量以30%為宜。輔料可以采用棉籽殼（木屑）75%，麸皮20%，石膏1%，石灰1%（石灰要根據實際情況進行調整将pH調到8-9即可）。将原料預濕拌勻即可。也可以使用純麸皮加上1%石膏，0.5%磷酸二氫鉀和适量石灰調節pH，再加水預濕即可，使用倆個配方中的任何一個配方都要将含水量調到60%～65%。

輔料準備完成後，将枝條和輔料混拌，讓枝條表面沾上輔料，即可裝袋。

選17 cm×33 cm×（0.005～0.007）cm聚丙烯塑料袋，每袋裝枝條85～100根。裝袋時先在袋底部墊放2 cm厚輔料，然後放入枝條，沿袋壁用輔料填實，再在枝條頂部蓋少量輔料，以覆蓋枝條為宜，也稱之“過橋”。裝料結束後套上頸圈，塞上棉塞或塑料，裝入筐中滅菌。

滅菌分為常壓滅菌100℃、15 h和高壓滅菌126℃、2 h，兩種滅菌方式。滅菌後待料溫降到25℃以下，按無菌操作接種，一般情況下，一支母種可以接5袋枝條種。

接種後放在暗光、溫度20～25℃，空氣相對濕度為70%左右的環境培養，其間适度通風。由于枝條培養基的通氣性好，菌絲生長迅速，培養時間比常規料縮短4-7天。

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