衛生檢驗與檢疫專業就業方向一般是疾控類單位：衛生檢驗檢疫、臨床檢驗、細菌檢驗; 檢驗類單位：衛生檢驗、食品檢驗、動植物檢驗; 日化、藥、食品類企業：産品質量檢驗。
衛生檢驗與檢疫專業的畢業生一般在疾病預防控制中心、醫院的檢驗科室、出入境檢驗檢疫局、食品藥品監督、農産品質量監督、衛生與計劃生育委員會、海關、食品公司、藥品公司、化妝品公司、自來水廠，環保局、質監局、醫療器械的銷售、第三方檢驗檢測測公司及部分監獄等就業。
衛生檢驗與檢疫專業就業方向還可以是衛生檢驗檢疫、臨床檢驗、細菌檢驗;檢驗類單位：衛生檢驗、食品檢驗、動植物檢驗;日化、藥、食品類企業：産品質量檢驗。
衛生檢驗與檢疫專業是一個近些年新興起的學科，一方面說明衛生檢疫人才儲備比較匮乏，另一方面國家将會重點培植大力發展，社會需要大量衛生檢疫方面的人才。
衛生檢驗與檢疫專業一般去向包括海關、動植物檢驗檢疫局、科研院所、大專院校以及食品衛生行業管理、企事業單位等，範圍很廣。因此，衛生檢驗與檢疫專業的學生就業趨勢還是比較樂觀的。
衛生檢驗與檢疫主要研究預防醫學、衛生理化檢驗及生物學檢驗等方面的基本知識和技能，在疾病預防控制中心、醫院檢驗科室、檢驗檢疫單位等進行衛生檢驗檢疫等。例如：甲流等大規模流行病的臨床檢驗、病理化驗，進出口動植物的檢驗檢疫，食品、藥品、化妝品等的質量檢驗、細菌檢驗等。
1、省、市、自治區各級疾病預防控制中心、衛生監督所，從事衛生理化檢驗、微生物檢驗和毒理學評價工作。
2、海關及省、市進出口檢驗檢疫局的相關檢驗科室，衛生檢驗與檢疫專業可從事進出口産品理化檢驗和微生物檢驗工作。
3、醫院檢驗科及營養科，從事生物材料檢驗與食品的生化、病毒和細菌學檢驗。
4、各級自來水公司，衛生檢驗與檢疫專業可從事水質理化和微生物檢驗。
5、各級環境監測站，衛生檢驗與檢疫專業可從事水質、土壤、空氣等環境樣品的檢測工作。
6、各類食品廠、化妝品廠等企業的産品檢驗科，衛生檢驗與檢疫專業可從事食品和化妝品産品質量檢驗。
7、衛生檢驗與檢疫專業可到技術監督局、藥檢所從事檢驗工作。
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