密碼子的使用偏好指的各種生物體偏愛使用三聯密碼子(即編碼相同氨基酸的密碼子)的現象。密碼子,即信使RNA鍊上決定一個氨基酸的相鄰的三個堿基,亦稱三聯體密碼。由于密碼子的簡并性,每個氨基酸至少對應1種密碼子,最多有6種對應的密碼子。不同物種、不同生物體的基因密碼子使用存在着很大的差異。
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