1、科屬不同
鲫魚是鯉科鲫屬下的動物統稱；鯉魚為鯉屬，别名鯉拐子、鯉子、毛子、紅魚。
2、外形不同
（1）鲫魚的腹面為銀灰色，體背面為青褐色，各鯺條均為灰白色，外形似鯉魚，但身體更高，背鳍、臀鳍都具有硬刺，後緣呈鋸齒形，跟鯉魚最大的區别是須，鯉魚嘴部有4根須，吻須一對，颌須比吻須長兩倍。
（2）鯉魚的體型稍大，兩側扁平，腹部圓潤，頭短小，吻鈍且鰓耙長，鰓絲細長，背面為灰黑色，背鯺前稍微隆起，側線下方為近于黃色、黑色，腹部為白色、背鯺微黑。
3、魚唇不同
鲫魚魚唇單薄肉少，口旁無須；鯉魚具兩對須，三排咽喉齒。
4、分布範圍不同
（1）鲫魚在全國各地（除西部高原）廣泛分布，是我國一種優良的養殖魚類和經濟魚類，全國各地水域常年均有生産，栖息在河渠、沼澤、湖泊、江河中，尤以水草茂盛的淺水湖和池塘較多，是一種适應性很強的魚類，繁殖能力極強。
（2）鯉魚原産亞洲，後引入歐洲、北美及其他地區，分布在除澳洲和南美洲外的全世界。是淡水魚類中品種最多、分布最廣、産量最高、養殖曆史最悠久者之一。單獨或成小群地生活于平靜且水草叢生的泥底的湖泊、池塘、河流中。
5、食性不同
成魚鲫魚主要以植物性食料為主。由于植物性飼料在水體中蘊藏豐富，品種繁多，供采食的面廣；鯉魚屬于底栖雜食性魚類，葷素兼食，餌譜廣泛，吻骨發達，常拱泥攝食。
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