一、憑票抵扣：
(1)從銷售方或提供方取得的增值稅專用發票(含稅控機動車銷售統一發票)上注明的增值稅稅額;
(2)從海關取得的海關進口增值稅專用繳款書上注明的增值稅稅額;
(3)從境外單位或者個人購進服務、無形資産或者不動産，為稅務機關或者扣繳義務人取得的解繳稅款的完稅憑證上注明的增值稅額。
(4)兩種電子普通發票可以憑票抵扣進項稅，相當于專用發票的使用：收費公路通行費增值稅電子普通發票、國内旅客運輸電子普通發票。其他增值稅電子普通發票不可以憑票抵扣進項稅。
二、計算抵扣：
(1)計算抵扣購進農産品的進項稅。購進方沒有取得增值稅專用發票、海關進口增值稅專用繳款書、完稅憑證，但可以自行計算進項稅額抵扣的情形——購進農産品，除取得增值稅專用發票或者海關進口增值稅專用繳款書外，按照農産品收購發票或者銷售發票上注明的農産品買價和9%計算進項稅額抵扣(納稅人購進用于生産或者委托加工13%稅率貨物的農産品，按照10%的扣除率計算進項稅額);
(2)納稅人支付的橋、閘通行費，暫憑取得的通行費發票上注明的收費金額按照下列公式計算可抵扣的進項稅額：橋、閘通行費可抵扣進項稅額=橋、閘通行費發票上注明的金額÷(1 5%);
(3)納稅人購進的國内旅客運輸服務不能取得專票或增值稅電子普通發票的，實行計算抵扣：航空旅客運輸進項稅額=(票價 燃油附加費)÷(1 9%)×9%;鐵路旅客運輸進項稅額=票面金額÷(1 9%)×9%;公路、水路等其他旅客運輸(如客運大巴)進項稅額=票面金額÷(1 3%)×3%
三、核定抵扣：
部分行業開展增值稅進項稅額核定扣除試點。這種方式在實際計算上體現出按照銷售實耗核定扣除。涉及行業：液體乳及乳制品、酒及酒精、植物油。以購進農産品為原料生産銷售規定産品的增值稅一般納稅人，納入了農産品增值稅進項稅額核定扣除試點範圍，其購進農産品無論是否用于生産這些産品，增值稅進項稅額均按規定進行核定抵扣。
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