靖康二年（1127年），金軍南下，攻陷汴梁（今開封），擄走兩宗北去，北宋滅亡，宋徽宗之子趙構在南京應天府（今河南商丘）正式即位，重建宋朝，是為宋高宗。在金軍進逼下，他一面任用嶽飛、韓世忠等抵抗金軍和僞齊，一面任用汪伯彥、黃潛善、秦桧等負責對金媾和，南徙揚州、建康（南京）、杭州、越州等地，最終在紹興八年（1138年）正式定都臨安（杭州），稱行在。那麼南宋為什麼選擇定都杭州，而不是六朝古都的南京？

南宋首都應是東京汴梁，而非其他什麼地方，臨安是行在，其他候選城市最多也隻能是行在，這在南宋初年，至少是官面上的共識，但是由于汴梁太過接近金國大軍的兵峰，且幾乎無險可守，這才有了駐跸何處的問題。

南宋建國初期南宋還用不着加那個“南”字，北方州郡尚存大半，兩淮、荊湖、川蜀、廣南基本穩定，當時宋廷在李綱、宗澤等大臣堅持下，也修複了部分地區的防禦能力，京畿路集結了号稱百萬的義軍，當時有三種主流意見建立行在：關中、襄陽、金陵，此外，宗澤在證明了自保能力後，還不斷上書促請趙構還都汴梁。

結果金兵前鋒南下，趙構二十萬禦營軍聚在身邊，卻不管北方的警訊，全不知抵抗，放着二十萬大軍和公卿百官、滿城百姓不要，立時自己逃過長江，在金兵追逐下連番改變駐跸所在，最終飄到了海上，金人稱之為為“搜山檢海”。

而在遷徙到杭州後，趙構也曾多次在主戰派官員要求下，數次返回南京建都，甚至已經在南京建造行宮和太廟，并把之前建在臨安的太廟降格為聖祖殿。但因為懼怕金國，趙構每次都尋找各種理由，最終返回杭州。

建炎二年（1128年）七月金太宗拒絕趙構的求和，派兵南下追擊趙構，此時宗澤去世，留守開封的杜充無力抵抗，隻能用決開黃河的方式阻擋金軍南下。此舉雖然給百姓造成災難，卻未能阻擋金軍的步伐，金軍轉而從山東繼續南下，此後金軍迅速攻陷了南宋的河北河南山東之地。

建炎三年（1129年）二月聽到金軍已攻陷天長，逼近揚州的消息後，趙構迅速逃到平江（今蘇州），在平江期間趙構跟杭州官員衛膚敏的讨論中，衛膚敏認為建康（南京）比杭州更适合做國都，并認為建康是王者之都，可以暫時去杭州躲避金軍鋒芒，但等金軍退兵後，應該還都建康，對此趙構也表示認同。

膚敏在維揚，數為帝言揚州非駐跸地，請早幸建康，帝思其言，複召入......為今之計，莫若暫圖少安于錢塘，徐詣建康。

因此雖然趙構一度去了杭州避難，但幾個月後，建炎三年（1129年）五月趙構就回到建康（南京），并将當時的南京由江甯改回古名建康，作為行在所。在這期間趙構明确對手下文武百官宣稱：“朕欲定居建康，不複移跸”。并任命洪皓為“大金通問使”，攜金乞和，表示“願去尊号，用正朔比于藩臣”，但金國沒有理睬趙構。

同年七月，趙構聽到金軍打算繼續南下進攻建康的消息，立刻将長江防務交給被趙構評價有“古之名将風範”的重臣杜充後，就逃往越州（今紹興），之後又逃往明州（甯波），定海等地，又渡海逃至昌國（舟山島）。

在這期間金軍提出了搜山檢海捉趙構的軍事行動，攻陷建康後，金軍一路南下，橫掃兩浙諸州縣，一直攻到了浙江沿海地區，而金軍主帥宗弼為了捉住趙構，就派阿裡、蒲盧渾為先鋒領兵四千人追襲趙構，阿裡軍連破宋軍，逼近明州，趙構登船逃入海上。

宗弼随後率軍趕到，取明州城，阿裡、蒲盧渾泛海至昌國縣（今浙江省舟山島），捉獲宋明州太守趙伯谔，得知宋高宗已取道溫州逃往福州，旱鴨子出身的金軍硬着頭皮又入海追擊，受到宋海上水軍的阻擊才退兵。

但在金軍退兵，建康等地被南宋收複後，南宋朝廷就又動了定都建康之議。

紹興四年（1134年）趙構在主戰派大臣張浚的建議下，下令移跸建康，并啟程前往建康，但在這一年金軍和僞齊南侵，僞齊軍一度攻陷楚州飲馬長江，趙構聽聞前方軍情後，行至平江就尋找各種理由逗留不前，次年趙構就以建康的官府沒有建造好為由，返回了杭州。

到了紹興六年（1136）僞齊再度南侵，這次僞齊皇帝劉豫請求金軍派兵助戰侵宋，金國居然拒絕派兵，任由劉豫自己看着辦，不想管僞齊的事。無奈之下，劉豫讓他兒子劉麟帶着手下的僞軍穿着金人衣服假裝成金軍南侵，然後就把駐守江淮防線的南宋中興四将之一的劉光世吓得夠嗆，負責江防的南宋劉光世等部被僞裝成金軍的劉齊僞軍，吓得要不戰而逃放棄江防，但被主戰派大臣張浚制止，然後在張浚的督戰下，宋軍擊敗僞齊軍，建康轉危為安。

經過這次勝利後，主戰派張浚再次敦請趙構前往建康，這次，趙構也膽氣大壯，終于下決心建都建康，紹興七年（1137）四月，趙構下令在建康建太廟，另将臨安的太廟降格為聖祖殿，就在南宋定都建康即将成為定局時，南宋的江北防線又出問題了。

紹興七年（1137年）八月，駐守江北的南宋軍隊原隸屬劉光世所部的統制官郦瓊、王世忠、靳賽等發動叛亂，殺死監軍官呂祉等人，帶領全軍四萬餘人，還有江北百姓十餘萬人投降僞齊劉豫，史稱“淮西兵變”，南宋江淮防線直接轟然倒塌，僞齊劉豫得到這一重大助力後，打算發兵南侵，但此時金國忽然廢掉了僞齊政權和劉豫的皇位，使得南宋得以保全江北之地。

但這次事件導緻主戰派張浚失勢，主張定都杭州的主和派秦桧、趙鼎上台，趙構對定都建康也産生了恐懼和懷疑，最終趙構選擇灰溜溜的退回杭州。

但同時為了平息輿論壓力，所以趙構在紹興八年從建康返回杭州後，雖然實際定都杭州，但隻給杭州行在所的名義，卻把留都（京）名義給了建康。

南宋皇帝不敢定都南京，另外一個重要原因就是南宋始終都沒能在江淮建立一個穩固的軍事防線，即便是在趙構退位後，南宋在江淮的經營可以說處處漏洞，此後的金宋對峙時期，金軍多次南下橫掃江淮，飲馬長江，趙構之後，金軍飲馬長江依然跟日常喝水一樣容易，當然這也體現了南宋統治者的短視和鴕烏，因為古往今來南北對峙之時，一旦江南最重要的地理屏障建康（南京）失守，後面的蘇杭也會在短時間内迅速淪陷。

有能力定都南京的政權必然要保證江北江淮一帶的控制權，說白了，控制江淮，就有進軍中原的可能性，南宋政權沒有能力對長江以北有絕對的控制力，隻能繼續往南後撤，因為南宋皇帝和大多文武沒有能力也沒有北伐的意志，彼時的南京或者說江淮一帶已經是宋金的戰争前線了，定都南京就是定都前線萬萬不可能。

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