1、PCR實驗靈敏度
PCR實驗靈敏度:是指PCR擴增反應能夠檢測到目的基因的最小值。
研究結果表明,影響PCR擴增效率的因素,有模闆的完整性、反應溫度、複雜程度、引物純度及其與模闆結合效率、DNA聚合酶的熱穩定性與擴增性能、反應緩沖液的離子組成(主要指:陽離子)、反應優化劑等,這些因素都顯著影響PCR實驗檢測靈敏度。在最佳擴增條件下,常規PCR反應能夠檢測到pg(10~12g)數量級目的基因。對于一個特定的目的基因,模闆與引物通常都是已經限定好的因素。因此,選擇什麼樣的PCR反應體系(包括DNA聚合酶與反應緩沖液等)就是研究者提高PCR實驗靈敏度的關鍵因素了。
2、PCR實驗特異性
PCR實驗特異性:是指在PCR擴增過程中,專一性擴增目的片段而非其他片段的性能。
在PCR實驗本身的靈敏度很高,且實驗條件未充分優化的情況下,通常會在目的片段出現同時伴随有其它雜帶,即發生非特異性擴增現象。模闆、引物性質及質量、反應條件控制等均會影響PCR擴增特異性。近年來的研究結果表明,緩沖液品質(如反應優化劑、離子種類與組成等)對保證PCR特異性擴增起着重要作用。
3、PCR靈敏性和特異性關聯
PCR實驗靈敏度與特異性是一對此長彼消特性,這也決定我們實驗體系調節實際上就是需要找到适合實驗靈敏度與特異性的平衡點。由于PCR體系中的成分衆多,使得組合較多,篩選工作也就相對繁雜。
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