該動漫講述的是鄉下女高中生宮水三葉和東京男高中生泷的穿越時空互換身體的愛情故事。
女主三葉生活糸守町鎮鄉下地方，但是三葉非常向往東京的生活，想和大帥哥約會，希望自己高中畢業後去往東京城市讀大學。不想再待在着無聊有悶的地方，沒想到的是自己真的夢到變成了一個在東京生活的高中生也就是男主泷。
不過時間久了發現自己并不是在做夢，竟然真的和男生泷互換了身體，然而并沒有規律進行互換身體，而是随機性的互換，于是兩人便在日記中定下規矩，希望身體互換事情不要被其他人發現。然而兩人也在互換的過程中漸漸産生了一定的感情。
當三葉占據泷的身體向一起打工的奧寺前輩約定好第二天的約會之時，第二天并沒有繼續互換身體，然而他們并不知道從這以後互換居然消失了。幾個月過去後，泷打算通過手機聯系三葉，可惜的是号碼居然無法打通，于是他根據夢裡記憶準備出發找到糸守鎮卻被奧寺前輩和同事發現，一起尋找泷口中所說的糸守町鎮。
然而糸守町鎮在三年以前因為被彗星分裂的隕石砸中而導緻幾乎糸守町鎮的居民都遇難，不過這時泷才發現自己和三葉互換的身體居然是在三年以前的事情。
不過後面在山上他們相遇并且互換成功了。為了避免兩人忘掉彼此的名字，兩人将對方的名字寫在掌心。一邊，泷反複地念着三葉的名字生怕自己忘記掉，然而另一邊，握着寫着字的手三葉匆忙的下山，嘴裡念着泷的名字生怕自己忘記。
最後還是記憶漸漸模糊導緻兩人都忘記了對方的名字，在三葉打開手掌時，發現上面寫的是，喜歡你，但是三葉知道有一個人喜歡着自己，但是現在自己應該去糸守町鎮通知居民，快離開哪裡。
然而在糸守鎮上彗星準備傍晚落在該鎮上三葉叫上小時候一起玩耍的同班同學名取早耶香和敕使河原克彥準備一起驅散居民炸掉糸守町鎮上的供電的地方，經過一系列的努力成功炸掉供電站，整個城鎮沒有了電，名取早耶香就在學院的廣播驅散民衆前往避難高中，卻被鎮長阻止。
然而三葉眼看彗星開始分裂前往鎮上不小心摔了一跤，聽見内心呼喊的聲音重新重新前往父親的房間，至此彗星掉落了下來。
畫面來到泷這邊，當泷看到新聞彗星墜落但是大部分居民都奇迹般的平安無事，因為那一天小鎮剛好準備舉行全鎮居民避難演練，泷也忘記了對方的名字可是心中尋找的另個人在哪裡看将目光看向手掌。
結局最後在樓梯上相互碰面的二人，互相喊到了對方的名字。
無論是畫面還是故事情節可以說得上是非常不錯，沒看過的同學必須要看的一部番，
《你的名字》由comix Wace Films公司制作
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