原創 Lau TG 爾雲間meta分析 雲生信學生物信息
上方藍字關注我們
之前我們介紹過以常規森林圖為基礎的單組率meta分析的操作。
以Stata為例,其實就是将數據轉換為ES, esES的類型,然後用metan得到森林圖和合并結果。
然而,單組率的meta分析還有一個命令:metaprop。它與“metan”有什麼區别?實踐是檢驗真理的唯一标準,一起用實例操作驗證一下。如圖1所示,一共有7個研究,n代表樣本量,case為某疾病的發生頻數,我們将分别運用metan, metaprop進行單組率meta分析的合并,看看結果是否存在差異。
圖1 示例數據
運行metan的操作代碼,得到合并結果。
gen p=case/n
gen se=sqrt(p*(1-p)/n)
metan p se, lcols(study) random xlabel(0.2,0.4,0.6,0.8) dp(3)
注:模型的選擇是meta分析的基礎内容,此處省略了異質性檢驗的操作過程,直接選擇了用随機效應模型進行森林圖的合并。
如圖2所示,合并結果為0.138 (0.098, 0.178),也就是發病率為13.8% (9.8%, 17.8%)。
圖2 基于metan的單組率meta分析森林圖
運行metaprop的操作代碼,得到合并結果。
metaprop case n, random cimethod(exact) lcols( study) xlab(0.2,0.4,0.6,0.8) dp(3)
如圖3所示,合并結果(發病率)為0.138 (0.098, 0.178),與metan得到的合并結果是一緻的。
圖3 基于metaprop的單組率meta分析森林圖
除了合并結果一緻,兩種方法得到的異質性檢驗結果也相同。那麼,兩者的區别是什麼?
第一,森林圖的結構。雖然看上去兩個圖形很相似,但有一個固有的區别。基于metan命令得到的森林圖,在随機效應模型時,左下角會有一行信息“NOTE: Weights are from random effects analysis”,而metaprop的森林圖是沒有的。此外,metan命令基于兩組的對比,所以默認繪制無效線(如本例的ES=0),而metaprop是專門為單組率meta分析而開發的,沒有無效線。
有人會覺得這又怎麼了,結果對就行了,何必在意這些細節。但是,如果metan可以滿足單組率meta分析的需求,就不會有metaprop的出現了。
兩者最大的區别是:metaprop不受數據特征的影響,簡單的說,當出現某個/某些研究的率為0%/100%,置信區間的範圍超過0%/100%時,metan不再适用,而metaprop依然可以得到合理結果。
再看一個例子吧。從下圖可以得知,C的率為100%,E的率為0%,G的率的95%CI的下限低于0%。用metan進行合并,出現了什麼問題?C、E被排除了,沒有參與合并。而G的95%CI出現了負值,這跟常規認知是不符的。
我們再看看metaprop的結果。C、E依然被納入分析,G的95%CI也不會出現負值。當然,要注意!當數據出現極端情況,應用metaprop進行合并的時候,需要對命令稍作調整,很簡單,加上“ftt”就行。
metaprop case n, random ftt cimethod(exact) lcols( study case n) xlab(0.1, 0.2, 0.3, 0.4) dp(3)
今天的分享就到這裡了,關于單組率的meta分析,如果你還有其他疑問,私信小編哦。歡迎關注!
,更多精彩资讯请关注tft每日頭條,我们将持续为您更新最新资讯!