1、有特異識别和切割的序列部位。
2、斷裂所形成的DNA片段常具有堿基互補的單鍊尾巴,即粘性末端。
3、内切酶的切割和修飾功能由兩個不同的酶催化所完成,即内切酶活性和甲基化作用活性是分開的。
4、 二型限制性酶DNA分子上兩個單鍊斷裂的部位通常不是直接相對的。
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