氫鍵存在于含有NOF這類元素的分子之中。
氫原子與電負性大的原子X以共價鍵結合,若與電負性大、半徑小的原子Y(OFN等)接近,在X與Y之間以氫為媒介,生成X-H…Y形式的一種特殊的分子間或分子内相互作用,稱為氫鍵。
在蛋白質的a-螺旋的情況下是N-H…O型的氫鍵,DNA的雙螺旋情況下是N-H…O,N-H…N型的氫鍵,因為這些結構是穩定的,所以這樣的氫鍵很多。此外,水和其他溶媒是異質的,也由于在水分子間生成O-H—…O型氫鍵。
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