麝香是常用中藥，"神農本草經"列為上品。
麝香中含有蛋白質與氨基酸， 麝香中含蛋白質約 25%。麝香中含有鉀、鈉、鈣、鎂、鋁、 鉛、氯、硫酸鹽、磷酸鹽和碳酸铵以及尿囊素、尿素、纖維素等。麝香酮為重要的有效成分，其含量占天然麝香肉中的1.58%——1.84%，占天然麝香毛殼中的0.90%——3.08%。
改善睡眠
麝香酮通過對戊巴比妥鈉的影響刺激肝髒微粒體藥物轉化酶，因此麝香具有刺激中樞神經，改善睡眠的作用。麝香酮亦有與天然麝香相似的對抗煙堿毒性作用。
開竅醒神
麝香辛香溫通，走竄之性甚烈，有極強的開竅醒神通閉的功效，可用于各種原因所導緻的閉證神昏，為醒神回蘇的重要藥物。無論寒閉、熱閉，均有很好療效，特别适宜于寒閉神昏。
活血通經
麝香辛香，開通走竄，可行血中之瘀滞，開經絡之雍遏，具有痛經、止痛之功。可用于治療血瘀經閉，症瘕，胸痹心痛，心腹暴痛，跌撲傷痛，痹痛麻木，難産死胎等。
消腫止痛
麝香辛香行散，有良好的活血散結，消腫止痛的作用，内服，外用均可，可用于治療臃腫瘰疬、咽喉腫痛等症。
活血散結
麝香有良好的活血散結，消腫止痛作用，内服，外用均有良效。
催生
麝香活血通經，有催生下胎之效。
抗癌
麝香對人體食道鱗癌、胃腺癌、結腸癌、膀胱癌等腫瘤細胞有抑制作用，濃度大作用更強。
治療心絞痛
麝香有興奮中樞神經系統的作用，特别是可以興奮呼吸，加速心搏，升高血壓，因而可以用做強心劑和興奮劑。冠心病患者心絞痛發作，或處于昏厥休克時，服用以麝香為主要成分的蘇合丸，病情可以得到緩解。
抗炎
麝香中的蛋白成分能增加 IgM 抗體， 在抗原 SRBC 存在下， 麝香能使實驗小鼠的脾髒明 顯增大，因此麝香具有一定的抗炎作用。
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