當發現甲狀腺結節後，應該找專業的甲狀腺專科醫師就診。通常醫師會進行詳細的病史詢問、查體及相關檢查，這将有助于對甲狀腺結節性質的判斷。伴有煩躁、多汗、心悸等 甲亢症狀的結節可能是高功能甲狀腺腺瘤，也可能是亞急性甲狀腺炎和橋本甲狀腺炎的早期表現；伴有甲狀腺功能低下的結節，一般可能為亞急性甲狀腺炎和橋本甲狀腺炎的後期表現；兒童期頸部有放射性治療病史的結節，或者非甲狀腺腫流行區兒童的甲狀腺結節惡性的概率大一些；有甲狀腺癌家族史的結節惡性比率高一些；多年存在的結節短期内無痛性明顯增大時要考慮惡變的可能。
發現結節後還應做一些必要的生化檢查，包括甲狀腺功能、甲狀腺自身抗體 及相關腫瘤标志物的測定。大多數甲狀腺結節患者的甲狀腺功能在正常範圍，伴有促甲狀腺激素(TSH)異常的結節需要進一步評估。甲狀腺特異性自身抗體促甲狀腺激素受體抗體(TRAb)、甲狀腺過氧化物酶抗體(TPOAb)、甲狀腺球蛋白抗體(TGAb)對自身免疫性甲狀腺炎的診斷有意義，對結節良惡性的區分一般無特殊意義。降鈣素是甲狀腺濾泡旁細胞分泌的激素，甲狀腺濾泡旁細胞也是甲狀腺内的一種細胞，其作用為分泌降鈣素，調節體内鈣的代謝。由濾泡旁細胞形成的惡性結節稱為髓樣癌，降鈣素在甲狀腺髓樣癌中一般升高明顯，因此在甲狀腺結節性質的判斷過程中，醫師會建議抽血查降鈣素以排除甲狀腺髓樣癌可能，當然，其他一些腫瘤标志物如CEA等，專科醫師也會根據情況建議患者檢查。
近年來，高分辨率超聲檢查儀普及，應用高分辨率超聲發現甲狀腺結節的敏感性很高，有助于甲狀腺結節性質的判斷；也可以在超聲引導下進行細針穿刺細胞學檢查，從而提高良、惡性結節的診斷準确率。
一般而言，甲狀腺結節的檢查需要在甲狀腺專科醫師指導下進行，綜合考慮病史、查體、實驗室檢查及影像學檢查結果才能對結節做出準确的判斷和評估，這對于個體化治療方案的選擇非常重要。
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