菏澤市目前下轄2區7縣，2區即牡丹區和定陶區。
這麼一說，經濟開發區和高新區的朋友會疑惑了，自己所在的街道和鄉鎮明明被開發區和高新區管理。為什麼不是4區7縣呢？在很多關于菏澤行政區劃的介紹中，為什麼隻有牡丹和定陶2區和巨野、東明等7縣呢？
同樣是“區”，經開區和高新區究竟與牡丹、定陶2區有何不同？
我們平時說的牡丹區、定陶區、巨野等區縣是按照行政區域劃分的，省、縣、鎮等都是行政單位，隻是級别不同。彼此之間有明确的地理分界線，例如各省之間有省界，各縣之界有縣界。
都擁有自己的省政府、縣（區）政府、鎮政府等等。在行政級别中，2區和7縣均是縣級行政區。在管理機構上，2區7縣都是由自己的區政府或縣政府直接管理，再往上一級才是菏澤市級。
菏澤經濟開發區和菏澤高新區均是簡稱，全稱是菏澤經濟技術開發區和菏澤高新技術産業開發區，二者目前均是省級的經濟開發區，國内所有城市都有自己的經濟開發區和高新區，分為國家級、省級、市級若幹個級别，是地方政府為集中力量發展經濟、聚集産業等為目的而劃定的特定區域，屬于經濟功能區，功能區不受行政區劃限制，可以跨行政區。
不論是經濟開發區還是高新區，均是屬于開發區的行列，并不是行政區。
在菏澤，菏澤經濟開發區和菏澤高新區則是菏澤市在牡丹區的範圍内劃出的特定區域，地仍是牡丹區的，這也是為什麼在地圖上搜索菏澤經濟開發區或菏澤高新區均顯示在牡丹路的原因之一。但不由牡丹區直接管理。
但每個城市所賦予各自開發區和高新區的權力不同，有的開發區和高新區除了主業外還被被賦予了社會事務管理權（有自己的管轄區域），有的則隻有發展經濟，負責招商引資、企業落地等經濟職能。
菏澤經濟開發區和高新區目前屬于前者。
經濟開發區下轄丹陽街道、嶽程街道、佃戶屯街道三個辦事處和陳集鎮；
菏澤高新區下轄萬福街道，呂陵鎮，馬嶺崗鎮。
因為是功能區，所以經濟開發區和高新區沒有區政府，作為市屬開發區，其管理機構是市政府的直接派出機構——菏澤經濟開發區管委會和菏澤高新區管委會，由市級直接管理。
在GDP和财政收支等方面，高新區和經濟開發區均單獨計算，不算入牡丹區（目前如此）。
菏澤經濟開發區也被成為市經濟開發區，因為除了菏澤市直屬的開發區，各縣自己也有自己的經濟開發區。
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