一般來說。普遍是認為種鴿配對的時候，五代之内的配對是近親配對，但是三代之内的配對是比較近的配對。所以也有一些鴿友隻是認為三代以内的配對才是近親配對。而說到近親配對，由于近親配對存在着一些弊端，所以很多的鴿友都不喜歡進行種鴿近親配對。當然，近親配對有好處，也有弊端存在。下面我們來說一些常見的問題。但是不要因為這些不一定出現的問題就放棄近親配對的方式。
第一，種鴿近親配對可能出現出的後代鴿子的質量不好的情況。種鴿近親配對可能出的後代鴿子的體質比較差一些，比較瘦弱，容易生病。看起來有點天生的問題。這也就是所謂的近親退化的問題。體質上面的退化确實是一個常見的問題。尤其是近親配對出的鴿子再次進行近親配對，然後再近親配對出的鴿子，這樣多重近親情況下，就比較有可能出現退化的情況。這是一個比較讓鴿友擔心的弊端。
第二，成績退化的情況。其實很多鴿友都有讓種鴿進行近親配對的情況，而且很多。而很多鴿友并沒有發現什麼明顯的身體退化的情況。但是成績卻莫名其妙變差了。很多人不知道為什麼，鴿子都是好鴿子，還是近親配對，為什麼不行呢？其實這個就是另一個弊端，成績退化的現象。所以近親配對也需要雜交配對，就是因為有時候成績退化，不滿意了，那麼就需要進行雜交摻血。
第三，羽毛的退化以及體型的退化的情況。如果說你的鴿舍裡面沒有新的鴿子進來，都是幾羽鴿子的後代。這些鴿子不斷進行配對，出的後代也互相配對。其實這就是不斷在近親配對了。如此一來鴿子就可能出現體型變小，羽毛質量不好的情況。尤其是體型變化的情況，這是很明顯的。所以在種鴿近親配對的時候，其實還會比較重視體型的選擇。大一些的體型更适合近親配對。
當然，近親配對的這些弊端雖然碰到的時候就是幾乎沒有辦法繼續讓這些鴿子比賽的，但是這些問題并不會很常見，而且也一般不會每一次都有問題。就算是一個種鴿配對，出的鴿子也可能有好鴿子，也有退化的鴿子。所以弊端可以控制，隻要多注意選擇，問題不大。
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