高通量測序樣本量要求-tft每日頭條

高通量測序樣本量要求

生活更新时间:2024-08-06 12:04:38

什麼是FASTQ格式

FASTQ格式是一種文本形式的格式，主要用于保存核酸序列和測序質量。序列和質量都用ASCII編碼來表示，是目前的高通量測序結果的标準。

FASTQ格式一般有四行：

序列編号和描述信息，用@開頭
序列，包括ATGC和N
以加号開頭，是序列标示和描述
質量信息，與第二行的序列對應

什麼是質量評分：

質量評分是一個堿基錯誤概率的對數值，質量得分和錯誤概率關系在下列表中：

Phred 質量分數

堿基錯誤概率

序列準确性

1 in 10

90 %

1 in 100

99 %

1 in 1000

99.9 %

1 in 10000

99.99 %

比如我們常說的Q30，就是指的質量分數在30分以上，就是序列準确性在99.9%以上的堿基在測序數據中的比例。

之前我們分享了SAM格式，回顧：生信必會的SAM格式，該怎麼看？如果文章對你有所幫助，請轉發給你身邊需要的人噢！
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