近年來,随着結構基因組學的興起,大量的蛋白質結構獲得了測定,為研究蛋白質的作用機理提供了重要的結構信息,測定方法如下:
專門存儲蛋白質和核酸分子結構的蛋白質數據庫中,接近90%的蛋白質結構是用X射線晶體學的方法測定的,X射線晶體學可以通過測定蛋白質分子在晶體中電子密度的空間分布,在一定分辨率下解析蛋白質中所有原子的三維坐标;大約9%的已知蛋白結構是通過核磁共振技術來測定的,該技術還可用于測定蛋白質的二級結構;除了核磁共振以外,還有一些生物化學技術被用于測定二級結構,包括圓二色譜;冷凍電子顯微技術是近年來興起的一種獲得低分辨率蛋白質結構的方法,該方法最大的優點是适用于大型蛋白質複合物的結構測定,并且在一些情況下也可獲得較高分辨率的結構,如具有高對稱性的病毒外殼和膜蛋白二維晶體。
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