位于青海省玉樹藏族自治州。被列入《世界遺産名錄》。也是中國建成的面積最大，海拔最高，野生動物資源最為豐富，自然環境較好的保護區之一。保護區位于玉樹藏族自治州西部，橫跨青海、新疆、西藏三省區之間的一塊高山台地，西與西藏相接，南同格爾木唐古拉鄉毗鄰，北和新疆維吾爾自治區相連，東至青藏公路，總面積4.5萬平方公裡。
青海可可西裡國家級自然保護區是羌塘高原内流湖區和長江北源水系交彙地區。可可西裡分為三個水系：東部為楚瑪爾河水系組成的長江北源外流水系，以雨水、地下水補給，水量較小，以季節性河流為主：西部和北部是以湖泊為中心的東羌塘内流水系，處于羌塘高原内流湖區的東北部；北部中段為柴達木盆地内流水系，以紅水河為主，穿越昆侖山流入柴達木盆地。保護區内河水流域幾乎遍及整個保護區；湖泊衆多，據統計面積大于1平方公裡的湖泊有107個，總面積3825平方公裡，湖泊面積在200平方公裡以上的有6個，1平方公裡以下的湖泊有7000多個，因此被稱為千湖之地。可可西裡現代冰川廣布，區内有冰川255條，面積750.7平方公裡，冰儲量816.489億立方米。保護區地處多年凍土地帶，凍土面積站保護區面積90%以上，凍土最厚達400米。冰川和凍土是巨大的固體水庫。青海可可西裡國家級自然保護區土壤類型主要有高山草甸土、高山草原土和高山寒漠土三個地帶性土壤。其次為沼澤土，零星分布的有草甸土、龜裂土、鹽土、堿土和風沙土等，土壤類型比較簡單。
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