支原體是介于細菌和病毒之間，無細胞壁，能在人工培養液上繁殖的最小原核細胞型微生物。引起泌尿、生殖系統感染的支原體主要是解脲支原體（UU）和人型支原體（Mh）。解脲支原體和人型支原體常寄生在人生殖道内，UU和Mh在特定條件下可以緻病；沙眼衣原體是介于病毒和立克次體之間，在細胞内寄生的原核細胞型生物，與生殖道感染密切相關。
支原體、沙眼衣原體感染後不進入組織和血液，隻能粘附在泌尿生殖道的上皮細胞表面的受體上，從宿主細胞中吸收營養，從細胞膜中獲得脂質和膽固醇，引起細胞的損傷。其代謝産生的有毒物質能産生神經毒素，引起細胞損傷；解脲支原體含有尿素酶，可以水解尿素産生大量氨，對細胞有毒害作用。
男性感染支原體後主要侵犯尿道、前列腺、精道、精囊和睾丸，引起尿道炎、前列腺炎，甚至影響精子的質量和生精功能，女性感染在宮頸，傳播方式主要通過性接觸傳播；但是，近年來不合格的衛生巾、衛生護墊，消毒不好的公用馬桶、浴巾、遊泳池都可能導緻支原體、沙眼衣原體的傳播。
支原體檢查出陽性說明什麼——研究發現，青春期前的男孩泌尿道很少有支原體寄居(0～2％)，而女孩中有8％～22％攜帶支原體。有性行為後，支原體的檢出率有所增加。無症狀的成年女性中的人型支原體檢出率約l8％，解脲脲原體為57％。而在成年男性中解脲脲原體檢出率亦達14％。所以多數健康已婚婦女的宮頸上皮細胞中寄生有解脲脲原體，為正常攜帶者。如果無自覺不适，同時婦科檢查無異常發現就不必治療。
有作者采用培養法對314名未婚統招大學生和 232名已婚成教大學生進行解脲脲原體和人型支原體的檢測。結果未婚大學生和已婚大學生泌尿生殖道支原體檢出率分别為 12.10 %和22.41% ,後者明顯高于前者 ;已婚男、女大學生泌尿生殖道支原體檢出率 (分别為 17.44 %和 27.78% )明顯高于未婚男、女大學生檢出率 (分别為 8.33%和 16.44 % )。
故而可認為支原體在正常人群中是會有部分正常攜帶的。美國CDC2010年尿道炎（宮頸炎）診斷指南指出性病性尿道炎的診斷标準時，推薦查淋球菌和衣原體，而沒有推薦查支原體，也可能是考慮到正常人群中的攜帶率的問題。故歐美國家将淋病之外的尿道炎确切定義為衣原體性尿道炎，而不是像以前那樣模糊稱謂“非淋菌性尿道炎”。但如果患者有不潔性生活，加之支原體陽性、炎細胞數量多且有不适症狀者還是應在皮膚科醫生的指導下進行治療的
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