肛瘘基本病因，是肛門直腸周圍感染形成不能愈合的慢性遷延性瘘道或窦道，它的大體感染來源分為：

肛瘘的腺源性肛瘘

一.腺源性肛瘘：肛管齒線位肛隐窩内的肛腺感染，沿着肛管直腸肌肉以及軟組織間隙蔓延擴散，形成了開口瘘道或者不開口的窦道，向下形成了低位肛瘘，向上超過肛直環(或瘘管在肛直環裡面)形成高位肛瘘。腹瀉、便秘、疲勞、抵抗力下降是幾個常見的誘因，90%肛瘘由此發生，治療較為容易，手術大多數能一次性治愈。

肛瘘的囊源性肛瘘

二.囊源性肛瘘：由肛門直腸的周圍間隙内(或盆底)囊性腫物生長體積增大及排便腸蠕動擠壓，囊壁移行至肛管直腸交界薄弱處(肛隐窩)，在抵抗力下降時誘發感染，形成囊性窦道或瘘道，頂端位置往往較高，有光滑、寬曠、分隔狀囊性内壁，常見于皮樣囊腫、表皮樣囊腫、畸胎瘤等，占高位肛瘘30%左右，因内壁有上皮組織不易完全祛除及囊壁較硬不易關閉愈合，難于一次性手術治愈，臨床上稱為“複發性複雜性肛瘘”。

肛瘘的裂源性肛瘘

三.裂源性肛瘘：由于肛裂繼發感染蔓延形成瘘管，因肛裂位置較低，多形成皮下瘘，是陳舊性肛裂常見并發症，多見于肛門前後正中位，前方發生複雜性肛瘘的較多，女性常見。

四.痔源性肛瘘：因血栓痔感染形成瘘管，多為皮下瘘，或向上形成粘膜下瘘，混合痔血栓形成感染形成的肛瘘内口多在齒線位痔體兩側，右前方母痔區發生較多，且易行成較為複雜的肛瘘。

肛瘘的腸源性肛瘘

五.腸源性肛瘘：由于慢性炎性腸病，如潰瘍性直腸炎、克隆氏病，潰瘍感染波及直腸壁向下形成瘘道至肛周，一般以原發病表現為主，肛瘘治愈較為困難。

肛瘘的醫源性肛瘘

六.醫源性肛瘘：因肛門直腸檢查、手術治療引起感染蔓延擴散形成肛瘘。主要是齒線位肛隐窩肛腺受損傷、分泌不暢引起感染繼發，常見不正确結紮痔核或縫線于齒線位引起。随着手術方式的改進，此類肛瘘發生逐漸少見;更少見于盆腔其它手術如直腸、子宮、膀胱、骶尾椎手術感染形成瘘道。

肛瘘的傷源性肛瘘

七.傷源性肛瘘：因誤吞魚骨、雞骨，排便時刺入肛管周圍組織或外來銳器直接刺穿肛管直腸周圍組織，引起感染擴散蔓延形成肛瘘，不易愈合多由異物存留組織間隙造成。

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