PubMed是生物醫學研究領域應用最廣泛也是最重要的數據庫，由美國國立衛生研究院（NIH）下屬的美國國立醫學圖書館（National Library of Medicine，NLM）的國家生物技術信息中心（NCBI）開發、維護。面向全世界免費提供最新的生物醫學信息。PubMed可檢索自1950年以來MEDLINE數據庫的期刊文獻以及其他生命科學期刊文獻。PubMed的信息資源主要包括Medline數據庫、PreMedline數據庫以及部分由出版商提供的數目信息。

PubMed整合在NCBI的統一檢索平台Enterz上，與該平台其他數據庫建立無縫鍊接，可實現跨庫檢索。可以說PubMed是生物領域科研人員必不可少的文獻數據庫，本期内容利刃君就為大家分享PubMed數據庫的基本用法。

01基本檢索

使用PubMed最基本的檢索方式就是直接在檢索框中輸入關鍵詞進行檢索。單純的模糊檢索一般會讓檢索結果很多，找到适合的文獻往往很費時間。此時，我們可以在基本檢索時，對關鍵詞進行組合檢索、添加截詞符号、特殊符号進行檢索，最常用的有以下幾種。

①布爾運算

也叫邏輯運算，即“與”、“或”及“非”，對應“AND”、“OR”及“NOT”，注意必須為大寫字母，分别對應交集、聯集和差集。

如我們需要檢索“人參皂苷在治療冠心病的應用”，這時可提取兩個關鍵詞“人參皂苷”和“冠心病”，就可以使用[ginsenosides AND “coronary heart disease”]進行檢索。

需要注意的是，邏輯算符具有優先順序，優先級為：NOT>AND>OR。

②括号（）

使用邏輯算符進行檢索時，如果需要改變優先順序，就可以添加括号，類似于數學中的邏輯，括号内的先運算。如使用[Ginsenosides AND （"Cervical cancer" OR "coronary heart disease"）]和[Ginsenosides AND "Cervical cancer" OR "coronary heart disease"]進行檢索的結果數量有明顯的差距。

③星号*

截詞符号，指在檢索詞的适當位置截斷。使用截詞檢索可對關鍵詞的一個局部進行檢索，檢索結果為凡滿足這個詞局部中的所有字符（串）的文獻，使用截詞檢索可有效提高查全率。如[chemotherap*] 可查到[chemotherapy]、[chemotherapautic]、[chemotherapeutical]等不同的詞性拼法。

④引号“”

如果關鍵詞包含多個詞，不想分開，可以使用引号包覆詞組進行檢索。如我們直接使用“coronary heart disease”進行檢索，檢索結果會将三個單詞分開，檢索結果可能并不是我們想要的。

添加引号進行檢索，檢索結果就精準了許多。

02限定檢索

使用更細節的檢索方法可以更精準地獲取文獻，如引入作者、期刊名、文章發表時間等。要實現這樣的功能，可在檢索時引入字段标記。比如我們要查詢“MarchantI”這個作者的文章，可以使用“Marchant I[au]”進行檢索，其中“au”表示“author”，即作者，這樣檢索結果均為該作者發表的文章了。

再比如我們使用“STAT3[ti]”進行檢索，表示檢索結果中文獻的标題必須有關鍵詞“STAT3”，其中“ti”表示“title”，即标題。

03高級檢索

在檢索框下方點擊“Advanced”可進入高級檢索界面，在高級搜索條件下，我們可以通過添加具體條件和運用邏輯符号更加精确地檢索想要的文獻。

高級檢索界面主要包含三個部分，很容易理解。

✅第一個部分“Add terms to the query box”可下拉式選擇檢索方式，可以很容易的實現組合檢索；

✅第二部分“Query box”為自主書寫檢索式進行檢索，我們在第一部分設置檢索時，這裡會自動生成檢索式，當然也可自己直接書寫檢索式；

✅第三部分“History and Search Details”記錄了檢索曆史和檢索式，我們也可将自己的檢索式保存，下次可直接使用。

比如我們需要檢索發表在J Enzyme Inhib Med Chem期刊上且标題含有“STAT3”的文獻，可以如下設置：

04Mesh主題詞檢索

主題詞檢索也是PubMed常用的檢索方式，比基本檢索更具優勢。主題詞檢索一般包括主題詞和副主題詞兩部分，主題詞是将文獻研究的主要論點概括成（标引）一個或多個規範化的語詞。副主題詞是對主題詞的某一特定方面的限定，具有專指性。

在PubMed首頁可以找到“MeSH Database”的入口，點擊該鍊接可進入主題詞檢索界面。

比如以糖尿病“Diabetes Mellitus”進行檢索，在檢索結果界面找到自己要檢索的主題詞；

這裡我們點擊第一條結果“Diabetes Mellitus”，在該界面可以查看副主題詞和主題詞的其他信息。副主題詞可以添加多個，也可以不添加。我們這裡勾選“diagnosis（診斷）”和“therapy（治療）”；

然後在頁面右側的“PubMed Search Builder”工具塊點擊“Add to search builder”生成檢索式，之後點擊“Search PubMed”進行檢索即可。

如果還需要加入其它檢索條件，可以利用曆史檢索模塊，進行邏輯組配再檢索。

本期内容就到這裡，如果您有什麼問題，歡迎留言告訴我們~

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