指蛋白質分子中所有原子的空間排列。即在蛋白質二級結構的基礎上,由于氨基酸殘基側鍊的相互作用,肽鍊進一步卷曲、折疊形成的立體結構或三維結構叫蛋白質三級結構。具有生物活性的蛋白質必須具有三級結構。
側鍊的相互作用可以形成各種次級鍵,以維持蛋白質三級結構的空間構象。次級鍵包括:疏水鍵(或疏水作用力)、鹽鍵、氫鍵、範德華引力、二硫鍵。其中疏水鍵、二硫鍵是主鍵。
四級結構:較大的球蛋白分子往往由兩條或兩條以上的多條肽鍊組成。這些多肽鍊本身都具有特定的三級結構,稱為亞基(subunit),亞基之間以非共價鍵相連。
蛋白質的四級結構是指組成蛋白質各亞基間的空間排列 。
由少數亞基聚合而成的蛋白質,稱為寡聚蛋白(oligomeric protein)。寡聚蛋白中的不同亞基可以用α、β、γ、δ、ε命名區分,亞基數目通常為偶數,種類一般不多。維持四級結構的作用力主要是疏水作用力,另外還有離子鍵、氫鍵、範德華引力等。
實際上好多蛋白質在發揮生理作用時常以二聚體或多聚體的形式存在。如膜上的受體。
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