這種新的緻病菌被命名為“華西諾卡菌”

近期，四川大學華西醫院冉玉平教授團隊從一名皮膚感染患者中發現了一種新的緻病性諾卡菌，并将其命名為“華西諾卡菌”（Nocardia huaxiensis sp. nov.）。研究的相關文章已發表于細菌分類學權威期刊“International Journal of systematic and evolutionary Microbiology”和皮膚科領域期刊“British Journal of Dermatology”上。

患者是一名59歲男性，發現左腳背結節、膿疱和結痂5個月。病發前一周，患者曾赤腳在污水中行走，沒有受傷。經過經驗性抗生素治療，膿疱并無緩解（下圖a）。

活檢塗片顯示革蘭氏陽性杆菌伴分支細絲（下圖b），培養物顯示被諾卡氏菌屬所覆蓋（下圖c），最終通過全基因組測序鑒定為一種新的諾卡氏菌（WCH-YHL-001T），并命名為華西諾卡氏菌（Nocardia huaxiensis）。

該細菌對甲氧苄啶-磺胺甲惡唑敏感。患者接受口服甲氧苄啶磺胺甲惡唑治療5個月，1年随訪無複發（下圖d）。

諾卡菌病（nocardiosis）是由諾卡菌屬侵犯人體所緻的一種少見的嚴重感染性疾病，既可發生于免疫功能抑制的宿主，亦可見于免疫功能正常的人。該病主要通過呼吸道吸入諾卡菌孢子、斷裂的菌絲片段或直接感染皮膚所緻，可累及全身多個組織、器官，其中肺、皮膚是最常見的感染部位。

1889年，Trevisan首次提出了諾卡氏菌屬的概念，屬于放線菌綱、諾卡氏菌科。諾卡氏菌屬的成員是好氧的、非運動的、過氧化氫酶陽性的、弱耐酸的、革蘭氏染色陽性且革蘭氏染色可變的、含有黴菌酸的放線杆菌，可形成廣泛分枝的基質菌絲，分裂成球狀到杆狀的單元和弱氣生菌絲。諾卡氏菌屬的化學分類學特征包括：細胞壁中存在内消旋-二氨基庚二酸，全細胞水解物中的阿拉伯糖和半乳糖，iso-支鍊和antesio-支鍊脂肪酸，磷脂型PII（磷脂酰乙醇胺），以及主要的甲喹酮MK-8（H4ω-環）。諾卡氏菌屬的基因組DNA G C含量在63-72 mol%之間。近幾十年來，從洞穴、土壤樣品、植物和臨床标本中分離出許多新菌種，在這項研究期間已有126種有效發表的菌種。

研究人員從該患者皮膚分離出來的WCH-YHL-001T菌株，呈革蘭氏染色陽性，好氧，異養，非運動。它們以短的氣生菌絲形成廣泛的基質，其分枝分裂成杆狀。該菌株可生長在10-40℃、pH 5.0-12.0和NaCl濃度為0-4.0%（w/v）的條件下。

WCH-YHL-001T的電鏡掃描形态

WCH-YHL-001T的主要細胞脂肪酸為C16:0、C18:1ω9c、C18:010-甲基，且脂肪酸類型為Summed feature 3（C-16 : 1 omega 7c/C-16 : 1 omega 6c）。主要呼吸醌為MK-8（H4ω-環）。主要極性脂質為磷脂酰乙醇胺、二磷酸甘油、磷脂酰肌醇甘露糖苷、未知磷脂和未知糖脂。肽聚糖診斷性二氨基酸為内消旋-二氨基庚二酸。全細胞糖譜由阿拉伯糖和葡萄糖組成。

WCH-YHL-001T與其鄰近諾卡氏菌屬的細胞脂肪酸組成

基于16S rRNA基因序列的系統發育分析表明，WCH-YHL-001T屬于諾卡氏菌屬。WCH-YHL-001T與諾卡氏菌屬類型菌株之間的平均核苷酸同源性（ANI）和矽内DNA-DNA雜交（isDDH）值均低于截止值（≥ANI和≥70%用于isDDH）定義細菌種類。基因組DNA G C含量為67.8mol%。系統發育、生理學和化學分類學數據表明，WCH-YHL-001T代表諾卡氏菌屬的一個菌種，将其命名為華西諾卡氏菌（Nocardia huaxiensis sp.nov.），模型菌株為WCH-YHL-001T（=GDMCC 4.181T=JCM 34475 T=NBRC 114973T）。

基于16S rRNA基因序列系統發育分析

▌參考文獻：

[1]Zhuang K, Liu Y, Dai Y, et al. Nocardia huaxiensis sp. nov., an actinomycete isolated from human skin. Int J Syst Evol Microbiol. 2021;71(8):10.1099/ijsem.0.004970. doi:10.1099/ijsem.0.004970

[2]Zhuang K, Ran Y. Primary cutaneous nocardiosis caused by a novel Nocardia species [published online ahead of print, 2022 Apr 28]. Br J Dermatol. 2022;10.1111/bjd.21599. doi:10.1111/bjd.21599

（來源：《感染醫線》）

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