紅豆杉産地主要有中國東北黑龍江、日本、朝鮮、俄羅斯(阿穆爾州、庫頁島等)、東北亞地區。
我國紅豆杉有4種1變種,分布于我國大部分地區。東北紅豆杉主要分布與吉林省長白山、黑龍江一帶,少量分布于遼甯東部山區。雲南紅豆杉主要分布于滇西與地州16個縣,總面積約9萬平方公裡, 其特點為分布廣、生長分散、無純林,多為林中散生木。南方紅豆杉主要分布于滇東、滇西南、滇東純林,多為林中散生木。西藏紅豆杉主要分布于雲南西北部、西藏南部、東南部。
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