主要區别在于科屬區别、形态區别。
1、科屬區别:絲瓜為植物界、被子植物門、雙子葉植物綱、合瓣花亞綱、葫蘆目、葫蘆科、冬瓜族、絲瓜屬一年生攀援草本植物。黃瓜為植物界、被子植物門、雙子葉植物綱、合瓣花亞綱、葫蘆目、葫蘆科、南瓜族、黃瓜屬一年生蔓生或攀援草本植物。
2、形态區别:絲瓜枝粗糙,有棱溝,被微柔毛,單葉互生,有長柄,葉片掌狀心形,雌雄同株,花冠淺黃色,瓠果長圓柱形,一般長20到60厘米,種子扁矩卵形,長約1點5厘米,黑色。黃瓜莖、枝伸長,有棱溝。卷須細,不分歧,具白色柔毛。果實長圓形或圓柱形,熟時黃綠色,表面粗糙,有具刺尖的瘤狀突起,極稀近于平滑。
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