雄海馬的尾部腹面有一育兒囊(位于肛門後端)<br>該囊是當第一次生殖來臨時,由尾部腹面左右伸出的皮招接合而成,隻留未端小孔。雌魚的洩殖腔未端在産卵期中也多少膨大,形成生殖乳突。此外,雄海馬的個體一般比雌魚稍大些。斑海馬體長一般為10-17厘米。體側扁,頭部似馬頭,腹部明顯突出。軀幹呈七棱形,尾部呈四棱形,尾較長漸細并向腹面卷曲,用以卷住海藻等作栖息用。吻細長,呈管狀,口甚小,位于近頭側背方。頭與驅幹部成直角。海馬全身無鱗片,完全由骨環所包被。魚體一般呈褐色,但随栖息環境的變化,體色可随之發生變化并與環境趨于一緻。體側第1、4、7體環的背方各有一黑色圓斑,故稱三斑海馬,這是分辨本種的主要特征。雄魚尾部腹面具有1個特殊的袋狀器官。
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