啟動子和起始密碼子并無共同點。啟動子是RNA 聚合酶識别、結合和開始轉錄的一段DNA 序列,它含有RNA 聚合酶特異性結合和轉錄起始所需的保守序列,啟動子本身不被轉錄。啟動子的特性最初是通過能增加或降低基因轉錄速率的突變而鑒定的。啟動子一般位于轉錄起始位點的上遊。信使RNA即mRNA的開放閱讀框架區中,每3個相鄰的核苷酸為一組,代表一種氨基酸,這種存在于mRNA開放閱讀框架區的三聯體形式的核苷酸序列稱為密碼子。由腺嘌呤,鳥嘌呤,胞嘧啶,尿嘧啶四種核苷酸可組成64個密碼子,其中有61個密碼子可編碼氨基酸。AUG既編碼甲硫氨酸,又作為多肽鍊合成的起始信号,作為起始信号的密碼子稱為起始密碼子。
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