根為肉質根,主根粗大,須根多,莖幹直、少分枝,成年的植株莖中空,頂芽生長正常時,側芽受抑制,主幹受傷,可促生側枝;花、株均分雄、雌和兩性,果實形狀有圓形、橢圓形、球形、梨形等,種子近圓形,黃褐色或黑色;番木瓜生長适溫為25至32攝氏度,氣溫下降到10攝氏度時生長受抑制,5攝氏度以下幼嫩器官受害,0攝氏度時植株會死亡,溫度超過35攝氏度會引起大量落花落果;番木瓜需水量大,但忌積水,對土壤适應性廣,但要求土質疏松、透氣性好,地下水位低。
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