埃及全國幹燥少雨,氣候幹熱。埃及南部屬熱帶沙漠氣候,夏季氣溫較高,晝夜溫差較大。尼羅河三角洲和北部沿海地區,屬亞熱帶地中海氣候,氣候相對溫和,其餘大部地區屬熱帶沙漠氣候。白尼羅河發源于南半球的熱帶草原氣候區,青尼羅河發源于北半球的熱帶草原氣候區,兩河汛期不同。
1月平均氣溫12攝氏度,7月26攝氏度;全境幹燥少雨,年均降水量50毫米到200毫米。餘大部地區屬熱帶沙漠氣候,炎熱幹燥,氣溫可達40攝氏度 。每年4月到5月間常有“五旬風”,夾帶沙石,損壞農作物。
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