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雜交後代的基因型計算

生活 更新时间:2024-12-18 17:47:04

雜交後代的基因型計算(不同試驗設計遺傳力的計算方法)1

前言

農業和林業, 經常涉及到要計算遺傳力的問題, 這是一個數量遺傳學問題. 和動物計算遺傳力不同, 植物和林木計算遺傳力時, 一般是使用家系遺傳力, 動物計算遺傳力一般是計算個體遺傳力.

他們的主要區别在于, 計算家系遺傳力時, 需要根據重複數, 對方差組分進行校正.

1, 單因素随機區組

比如有10個品種, 在一個地點有3次重複, 表型數據是小區的産量和百粒重, 試計算産量和百粒重的遺傳力.

問題的解決思路:

  • 1, 單因素方差分析, 或者使用混合線性模型
  • 2, 會得到品種的方差組分Vg和殘差的方差組分Ve
  • 3, 遺傳力的計算方法是Vg/(Vg Ve)

複雜的方法

首先, 計算方差組分, 如果是使用方差分析的形式, 可以使用這個公式進行轉化:

雜交後代的基因型計算(不同試驗設計遺傳力的計算方法)2

這裡的加性方差組分和殘差方差組分的計算公式為:

雜交後代的基因型計算(不同試驗設計遺傳力的計算方法)3

簡單的方法

使用混合線性模型, 将品種作為随機因子, 重複作為固定因子, 得到品種的方差組分(Vg)和殘差的方差組分(Ve), 然後直接計算遺傳力即可.

雜交後代的基因型計算(不同試驗設計遺傳力的計算方法)4

2, 一年多點試驗遺傳力計算

比如有10個品種, 在一個地點有4個地點(L), 每個地點有3次重複(R), 表型數據是小區的産量和百粒重, 試計算産量和百粒重的遺傳力.

這個試驗中, 需要考慮不同地點與品種的互作效應, 即要考慮G by E, 使用混合線性模型, 可以這樣寫:

固定因子: 地點 地點:重複

随機因子: 品種 品種:地點

雜交後代的基因型計算(不同試驗設計遺傳力的計算方法)5

注意

如果每個地點的品種數不一樣, 這裡地點的L和R, 需要用調和平均數.

3, 多年多點試驗遺傳力計算

比如有10個品種, 在一個地點有4個地點(L), 每個地點有3次重複(R), 共有3年(Y))的數據, 表型數據是小區的産量和百粒重, 試計算産量和百粒重的遺傳力.

這個試驗中, 需要考慮不同地點與品種的互作效應, 即要考慮G by E, 使用混合線性模型, 可以這樣寫:

固定因子: 地點 年份 地點*年份 年份:地點:重複

随機因子: 品種 品種:地點 品種:年份 品種:地點:年份

雜交後代的基因型計算(不同試驗設計遺傳力的計算方法)6

注意

如果每個地點的品種數不一樣, 這裡地點的L, G, R, 需要用調和平均數.

如果模型中,有些方差組分為0,将其去掉即可。 比如多年多點分析中,如果Year*Cul方差組分為0,那就在模型中将其去掉重新分析即可。

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