DNA的二級結構是指兩條多核苷酸鍊反向平行盤繞所生成的雙螺旋結構。兩條多核苷酸鍊以相同的旋轉繞同一個公共軸形成右手雙螺旋,螺旋的直徑2.0nm;兩條多核苷酸鍊是反向平行的,一條5’-3方向,另一條3’-5’方向;兩條多核苷酸鍊的糖-磷酸骨架位于雙螺旋外側,堿基平面位于鍊的内側;相鄰堿基對之間的軸向距離為0.34nm,每個螺旋的軸距為3.4nm。
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