根據益生菌在兒科應用的循證臨床實踐指南，不同疾病所推薦的益生菌如下：

兒童急性腹瀉病

布拉酵母菌散，雙歧杆菌三聯活菌散，雙歧杆菌四聯活菌片，枯草杆菌二聯活菌顆粒，酪酸梭菌活菌散劑，酪酸梭菌二聯活菌散，地衣芽孢杆菌活菌顆粒，複合乳酸菌膠囊 ，雙歧杆菌乳杆菌三聯活菌片 和雙歧杆菌三聯活菌腸溶膠囊。

遷延性及慢性腹瀉病

布拉酵母菌散，雙歧杆菌三聯活菌散 ，雙歧杆菌三聯活菌腸溶膠囊，雙歧杆菌四聯活菌片 ，枯草杆菌二聯活菌顆粒 ，酪酸梭菌活菌散劑 ，雙歧杆菌乳杆菌三聯活菌片和複合乳酸菌膠囊。

抗生素相關性腹瀉（AAD）的預防

布拉酵母菌 ，酪酸梭菌二聯活菌散 ，雙歧杆菌三聯活菌散/膠囊，雙歧杆菌乳杆菌三聯活菌片 ，酪酸梭菌活菌散劑 ，枯草杆菌二聯活菌顆粒 ，和地衣芽孢杆菌。艱難梭菌相關性腹瀉推薦使用布拉酵母菌。

化療相關性腹瀉（CID）的防治

酪酸梭菌二聯活菌散 ，雙歧杆菌四聯活菌片 ，雙歧杆菌乳杆菌三聯活菌片和地衣芽孢杆菌活菌顆粒。

乳糖不耐受

雙歧杆菌乳杆菌三聯活菌片，枯草杆菌二聯活菌顆粒 ，雙歧杆菌三聯活菌散 和酪酸梭菌二聯活菌散。

功能性便秘

雙歧杆菌三聯活菌散，雙歧杆菌三聯活菌腸溶膠囊 ，雙歧杆菌乳杆菌三聯活菌片，枯草杆菌二聯活菌顆粒 ，酪酸梭菌二聯活菌散，布拉酵母菌 和地衣芽孢杆菌。

幽門螺杆菌（Hp）感染

布拉酵母菌，雙歧杆菌四聯活菌片 ，酪酸梭菌二聯活菌膠囊，枯草杆菌二聯活菌顆粒 ，雙歧杆菌乳杆菌三聯活菌片 和雙歧杆菌三聯活菌散/膠囊/腸溶膠囊。

新生兒壞死性小腸結腸炎

雙歧杆菌三聯活菌散，雙歧杆菌乳杆菌三聯活菌片 ，酪酸梭菌活菌散劑，布拉酵母菌，酪酸梭菌二聯活菌散 ，枯草杆菌二聯活菌顆粒 和雙歧杆菌四聯活菌片。

新生兒黃疸

枯草杆菌二聯活菌顆粒，雙歧杆菌三聯活菌散/膠囊，地衣芽孢杆菌活菌顆粒，布拉酵母菌 ，雙歧杆菌四聯活菌片，雙歧杆菌乳杆菌三聯活菌片 和酪酸梭菌二聯活菌散。

早産兒喂養不耐受

雙歧杆菌乳杆菌三聯 活 菌 片 ，雙 歧 杆 菌 三 聯 活 菌 散，雙歧杆菌三聯活菌膠囊/腸溶膠囊，枯草杆菌二聯活菌顆粒，酪酸梭菌活菌散，布拉酵母菌散 ，酪酸梭菌二聯活菌散 和雙歧杆菌活菌膠囊。

過敏

雙歧杆菌三聯活菌散，雙歧杆菌乳杆菌三聯活菌片，雙歧杆菌四聯活菌片，酪酸梭菌活菌散劑，枯草杆菌二聯活菌顆粒，凝結芽孢杆菌活菌片，布拉酵母菌散 和酪酸梭菌二聯活菌散。

參考：中華預防醫學會微生态學分會兒科學組《益生菌兒科臨床應用循證指南》

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