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羊在散養情況下疾病較少。現在養殖密度加大，有的已形成規模化飼養，在條件變化後，疾病傳播機率加大，疾病相對增多，更應重視免疫接種疫菌苗和加強消毒、衛生工作。除寄生蟲病外，羊的病毒性和細菌性傳染病有20餘種，病毒病有羊痘、藍舌病、口蹄疫、羊傳染性膿疱等；細菌病主要是梭菌感染，如羊快疫、羊黑疫、羊猝疽、羊腸毒血症等；此外，還有羊布氏杆菌病、羊李氏杆菌病、破傷風、山羊傳染性胸膜肺炎、羊大腸杆菌病和羊沙門氏菌病等。但整個疾病預防，不僅隻靠疫菌苗等預防，還得要加強消毒、衛生和飼養管理等綜合措施。
目前羊常用的疫菌苗有羊痘疫苗，主要是山羊痘細胞菌，每隻羊每年免疫1次，3月齡内的哺乳羔羊，在斷奶後應加強免疫1次；口蹄疫疫苗，在發病地區定期免疫接種，應給羊注射國家認可的同型口蹄疫疫苗；傳染性胸膜肺炎氫氧化鋁苗，6月齡以下山羊皮下注射3毫升，6月齡以上山羊注射5毫升；羊快疫、羊黑疫、羊猝疽、羊腸毒血症和羔羊梭菌性痢疾，都是梭菌性疾病，可根據本地流行情況用三聯（羊快疫、羊猝疽、羊腸毒血症）、四聯或五聯（羊快疫、羊猝疽、羊黑疫、羊腸毒血症和羔羊痢疾），皮下或肌内注射5毫升，免疫期半年以上。懷孕母羊産前定期注射五聯菌。其他菌苗要根據本地羊流行病學情況而定，如有羊傳染性膿疱，可在每年3月或9月用該病弱毒細胞凍幹苗每隻羊口腔粘膜注射0.2毫升。以及羊藍舍病、布氏杆菌苗、大腸杆菌苗、沙門氏菌苗等。預防接種疫苗應由當地獸醫部門負責和指導下進行。常年非種用羊的免疫接種為：3月份羊痘病，皮内注射0.5毫升；羊三聯菌，肌内注射5毫升。4月份羊口蹄疫苗，肌内注射，成年羊2毫升、青年羊1毫升。5月份傳染性胸膜肺炎苗，皮下注射，6月齡以下羊3毫升，6月齡以上羊5毫升。9月份羊三聯苗，肌内注射5毫升。10月份羊口蹄疫苗，肌注，成年羊2毫升、青年羊1毫升。11月份傳染性胸膜肺炎菌苗，皮下注射6月齡以下羊3毫升，6月齡以上羊5毫升。
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