該校9個學科進入ESI全球前1%，擁有5個一級學科國家重點學科和9個二級學科國家重點學科（涵蓋38個二級國家重點學科），46個福建省一級學科重點學科，9個國家基礎科學人才培養基地。擁有31個博士後流動站，31個博士學位授權一級學科，50個碩士學位授權一級學科，8個交叉學科專業授權點；22個專業學位授權點。
福建師範大學
學校擁有國家重點學科1個、省高校優勢學科創新平台（含培育）3個、省特色重點學科9個、省重點學科26個，博士後科研流動站19個，博士學位授權一級學科19個,碩士學位授權一級學科37個，碩士專業學位授權點13個，還擁有高校、中職教師在職攻讀碩士學位授權點。6個學科在全國第三輪學科評估中進入全國同類學科前20名，其中3個學科進入全國同類學科前10名。化學學科進入ESI全球排名前1% 。
福州大學
學校有國家重點學科1個（物理化學）、國福州大學.旗山校區夜景家級重點（培育）學科1個（結構工程）、省級優勢學科創新平台5個、省級特色重點學科6個、省級重點學科26個；化學、工程學和材料科學3個學科進入國際ESI學科排名前1%。
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