1、哈爾濱醫科大學附屬第一醫院。
哈爾濱醫科大學第一臨床醫學院始建于1949年，是一所三級甲等綜合性醫院。2018年12月4日，被國家衛健委公布為首批腫瘤多學科診療試點醫院。
學院擁有心血管内科、神經外科、普通外科、神經内科、骨科、眼科、婦産科、傳染科等一系列國内知名的重點學科，共有87個臨床科室，24個醫技科室，設4個診室、3個實驗室(性病實驗室、真菌實驗室、病理實驗室)、2個治療室(光療及激光室、普通治療室)。
2、哈爾濱醫科大學附屬第二醫院。
哈爾濱醫科大學附屬第二醫院(The Second Affiliated Hospital of Harbin Medical University)創建于1954年，是綜合性三級甲等醫院。2017年11月，獲第五屆全國文明單位榮譽。
醫院設有44個臨床科室、13個醫技科室。擁有國家新藥臨床實驗研究中心、國家藥品臨床研究機構、省部共建教育部心肌缺血和診療技術重點實驗室、黑龍江省器官移植中心、産前診斷與遺傳病診斷中心、血液淨化中心、風濕病研究所、心血管外科研究所、黑龍江省麻醉與危重病學重點實驗室、黑龍江省高校藥物研究重點實驗室、麻醉基礎理論與應用重點實驗室、哈爾濱醫科大學血液病研究所、藥學藥物研究所、呼吸病研究所、生殖内分泌醫學中心。
3、黑龍江中醫藥大學附屬第一醫院。
黑龍江中醫藥大學附屬第一醫院暨黑龍江中醫藥大學臨床醫學院創建于1963年，位于黑龍江省哈爾濱市動力區和平路26号，占地面積13萬平方米，是一所集醫療、教學、科研、康複為一體的三級甲等綜合性中醫醫院。
醫院設有心血管科、呼吸科、血液病科、腎病科、肝脾胃病科、重症醫學科、手術麻醉科、口腔科、眼科、骨傷科、婦科、産科、周圍血管病科、保健中心、内分泌科、針灸科、癫痫治療中心、外科、皮膚科、推拿科、風濕病科、腫瘤科、耳鼻喉科、康複科、檢驗科、病理科、物理診斷科、超聲醫學科、放射科等臨床和醫技科室。
其中，擁有國家級重點學科2個，國家中醫藥管理局重點學科7個，黑龍江省人事廳重點學科4個，黑龍江省教育廳重點學科4個，黑龍江省級重點專科12個，黑龍江省級重點專病4個。
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