氫鍵不是化學鍵。氫鍵是指生成X-H…Y形式的一種特殊作用,分為分子内氫鍵、分子間氫鍵。
氫原子與電負性大的原子X以共價鍵結合,若與電負性大、半徑小的原子Y(OFN等)接近,在X與Y之間以氫為媒介,生成X-H…Y形式的一種特殊的分子間或分子内相互作用,稱為氫鍵。X與Y可以是同一種類分子,如水分子之間的氫鍵;也可以是不同種類分子,如一水合氨分子(NH3·H2O)之間的氫鍵。
在蛋白質的a-螺旋的情況下是N-H…O型的氫鍵,DNA的雙螺旋情況下是N-H…O,N-H…N型的氫鍵,因為這些結構是穩定的,所以這樣的氫鍵很多。此外,水和其他溶媒是異質的,也由于在水分子間生成O-H—…O型氫鍵。因此,這也就成為疏水結合形成的原因。
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